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利用生物信息学分析酪氨酸激酶抑制剂治疗斑秃的效应机制

2021-08-02王小莉王用峰连莉阳王李雯屈煦张荣强张志刚

关键词:小鼠差异信号

王小莉 ,王用峰 ,连莉阳 ,王李雯 ,屈煦 ,张荣强 ,张志刚

(1.陕西中医药大学附属医院,陕西 咸阳 712000;2.陕西中医药大学,陕西 咸阳 712046)

斑秃(Alopecia areata,AA)是一种突然发生的局限性斑片状脱发,可发生于身体任何部位,任何年龄均可发病,人群发病率为0.9%~6.9%[1-2]。随着经济的发展和生活工作压力的增大,AA发病率逐年增加。研究表明,C3H/HeJ AA小鼠经酪氨酸激酶(JAK)抑制剂全身给药后消除了干扰素(IFN)特征并阻止了AA的发展,局部给药促进了AA皮损部位毛发再生和疾病的逆转[3]。临床实践中,AA虽有多种疗法,但目前尚无美国食品和药物管理局批准的抗AA疗法或针对AA的循证疗法[4]。临床研究发现,中重度患者经口服鲁索利替尼治疗3~6个月后,75%患者的AA皮损部位毛发几乎完全再生(92%的毛发再生),AA得到显著改善[5]。那么,JAK抑制剂治疗AA的可能效应机制是什么呢?本研究采用生物信息学技术对AA小鼠经JAK抑制剂鲁索利替尼、托法替尼治疗前后皮损皮肤组织的基因芯片数据进行分析,以期获得JAK抑制剂治疗AA的关键信号通路和生物学标志物,为JAK抑制剂治疗AA的临床应用及其机制研究提供参考依据。

1 材料与方法

1.1 数据来源 在PubMed GEO DataSets中以“Alopecia areata”为检索词检索,获得Jabbari等[6]2013年3月26日提交并于2018年8月23日更新的基因芯片数据 GSE45514(ID:5273),该数据采用Affymetrix Mouse Genome 430 2.0 Array平台GPL1261检测。该数据集共有45 101个基因表达数据,包含31个样本。根据研究设计和结果,本研究中选取鲁索利替尼(Skin-J1组)、托法替尼(Skin-J3组)干预前和干预12周皮损皮肤组织基因芯片数据,进一步深入分析。

1.2 差异表达基因的筛选和……

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