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依托高性能计算平台的《生物信息学》项目教学法探索

2021-07-21邵俊杰王喜宏

家畜生态学报 2021年6期
关键词:生物能力教学

李 冉,邵俊杰,王喜宏,姜 雨

(西北农林科技大学 动物科技学院,陕西 杨凌 712100 )

生物信息学作为跨越和融合生命科学与信息技术的新兴学科,是生命科学最具活力的前沿领域之一[1]。目前,国内多所涉农高校已经在动物科学专业开设了生物信息学课程。但生物信息学知识量大、学科交叉性强,涉及到计算科学、生物统计学、分子生物学和基因组学等多个学科,知识更新节奏快,对教师的综合能力要求高。大部分高校对该门课程的教学仍然处于探索阶段,尚未形成成熟的教学体系,在教学过程中课程内容陈旧,与流行的测序技术和数据分析严重脱节[2]。此外,大量生物信息分析依赖高性能计算服务器进行,因此,学生需要熟悉操作Linux系统和掌握基本的计算机编程技能,然而受到硬件设备条件的限制,大部分高校的生物信息学实践教学依然使用一些图形界面软件或在线工具进行简单的数据分析练习[3],不能满足未来从事科研工作的需要。

项目教学法通过整合教学资源,对课程内容重新组合,师生共同克服课程不同章节内容的条块,促使学生以解决问题为导向,采用各种途径获取学习资源,构建良好的知识获取和专业技能训练网格[4]。欧洲生物信息学研究所等国外研究院所长期基于项目教学法开展生物信息学教学工作,取得了良好的效果[5]。

笔者多年来一直从事生物信息学教学科研工作,针对动物科学专业特点进行了多年的教学改革探索,利用西北农林科技大学高性能计算平台,设计了针对基因组大数据的实验项目,实战性和趣味性强,激发了学生对该门课程的热情,教学效果反馈较好。……

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