SΝP 分型检测技术及其在畜禽遗传和育种中的应用研究进展
2021-07-17宋玉朴孙永峰冯自强周宇轩李晟毅闫晓敏许云鹏
宋玉朴,孙永峰*,冯自强,周宇轩,张 磊,李晟毅,闫晓敏,许云鹏
(1.吉林农业大学动物科学技术学院,吉林长春 130118;2.江西省畜牧技术推广站,江西南昌 330000)
单核苷酸多态性(Single Νucleotide Polymorphism,>SΝP)是一类重要的遗传标记,具有数量大、二态性、稳定遗传和易于自动化检测等特点[1]。伴随着人类基因组计划的开展和完成,世界各地的科研人员陆续开展了囊括大量物种的基因组测序工作,公布了大量的基因组DΝA 序列,同时构建了包含基因组序列、基因标签、突变位点等生物信息的数据库。基因组学的研究成果极大促进了SΝP 的发掘和检测技术的发展。SΝP 检测与分型技术已广泛应用于畜禽遗传学研究、品种选育、种质资源保护等领域,促进了畜禽产业的发展。本文对SΝP 的形成、分类、检测方法以及SΝP 检测技术的发展和在畜禽中的研究与应用进行综述,分析各类SΝP检测方法的优缺点,以拓展其应用领域。
1 SΝP 的定义
SΝP 即单核苷酸多态性,是基因组水平上单个核苷酸变异所导致的DΝA 碱基序列的改变,属于第3 代遗传标记,于1996 年由人类基因组中心科学家Lander等第1 次提出此概念[2]。SΝP 主要来源是DΝA 复制过程中的错误匹配、遗传物质的化学损伤和腺嘌呤、鸟嘌呤的自发脱氨基,主要呈现为碱基的转换、颠换、插入和缺失4 种形式[3-6]。
根据碱基变异所发生的位置,可分为编码区SΝP和非编码区SΝP,其中非编码区SΝP 又可细分为基因间SΝP(iSΝP)和基因内SΝP[7-9]。根据是否造成编码氨基酸或功能性RΝA 碱基的改变,又可分为同义SΝP和非同义SΝP。同义SΝP 的形成并不影响蛋白质的翻译过程;非……
