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肺腺癌中核黄素转运体2基因和蛋白表达及功能的生物信息学分析

2021-07-06贾春丽路鹏霏邱萍沙娅马哈提杨颖包永星张华

疑难病杂志 2021年6期
关键词:肺癌数据库分析

贾春丽,路鹏霏,邱萍,沙娅·马哈提,杨颖,包永星,张华

原发性肺癌的发病率和病死率在世界范围内居于首位,其中非小细胞肺癌约占85%,以肺腺癌为主。据估计仅在2018年全球新增肺癌患者达209万,而肺癌所造成的死亡人数占癌症相关死亡人数的近20%。尽管新生物标志物和治疗方法的发现对肺癌诊疗做出了巨大贡献,但由于肺癌的生物学复杂性和不良预后,肺癌患者生存率仍然很低[1-2]。因此寻找新的肺癌治疗干预靶点尤为重要。

核黄素转运体2(riboflavin transporter 2,RFT2),是一种跨膜蛋白,又名hRFT2、SLC52A3、C20orf54,是核黄素转运蛋白家族中的重要一员,其作用主要是进行核黄素转运。有研究证明,核黄素的缺失与肿瘤的发生及发展具有密切的关系,人类及其他哺乳动物所需核黄素由饮食获得或肠道微生物合成[3],RFT2在核黄素吸收及调节核黄素组织分布过程中发挥的作用尤为重要。其在肺腺癌发生发展中的作用尚不十分清楚,本研究拟利用肿瘤公共数据库中该基因的相关信息,探究该基因在肺腺癌中的表达以及在发生、发展、预后中的作用,报道如下。

1 资料与方法

1.1 RFT2 mRNA 在肺腺癌中的表达及患者生存状况分析 在GEPIA 数据库(http://gepia.cancer-pku.cn)中输入RFT2,在样本数据库中选择肺腺癌,分析RFT2在肺腺癌组织、癌旁组织及不同临床分期肺腺癌组织中的表达水平。进一步分析其与肺腺癌患者总生存时间(overall survival,OS) 及无病进展生存时间(disease free survival,DFS)的关系。以RFT2表达水平的中位数为标准,分为高表达组和低表达组,对样本中肺腺癌患者进行生存分析。……

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