新型冠状病毒核酸荧光型RT-RAA检测方法的建立及其评价
2021-07-02刘伯玉任翠平芦宝静
安徽医科大学学报 2021年6期
高 越,刘伯玉,任翠平,高 勇,朱 禹,杨 莉,温 萌,钱 振,芦宝静,柳 燕
新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 19,COVID-19)是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的急性传染病。此次疫情在全球范围内快速蔓延,WHO已将其认定为国际公共卫生紧急事件。冠状病毒(coronavirus,CoVs)是一种有包膜的单链正链RNA病毒,隶属于冠状病毒科。病毒基因组中16个非结构蛋白由5′端的开放阅读框架(ORF)1a/b编码,而结构蛋白包括刺突蛋白(S)、包膜蛋白(E)、膜蛋白(M)和核衣壳蛋白(N)则由3′端的其他ORF编码。由于潜伏期长,感染者的早期症状无特异性,且存在无症状感染者,极易造成漏诊或误诊,因此,建立更便捷、快速的分子检测方法,为临床提供精准诊断具有重要意义。
该研究建立的反转录重组酶介导核酸扩增(reverse transcription recombinase aided amplification,RT-RAA)技术是一种等温快速扩增检测方法,通过是选择SARS-CoV-2的S
基因和orf1ab
基因,设计特异性等温扩增引物和探针,建立了SARS-CoV-2快速诊断的分子检测方法,并进行初步评价。1 材料与方法
1.1 材料
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样本 收集2020年1月20日—2月28日的临床确诊感染SARS-CoV-2患者咽拭子标本30例来自于项目合作单位安徽省阜阳市第二人民医院,COVID-19的诊断依据是中国国家卫生委员会发布的新的《冠状病毒肺炎防治方案(第五版)》;另外临床呼吸道感染咽拭子标本30份为2019年底前本实验室收集,经核酸检测分别包括H9N2(3例)、H7N9(2例)、H3N2(5例)、H1N1(6例)、B型流感(6例)、RSV(3例)、RV(5例)。纳入研究的所有患者都知情同意,经安徽医科大学人类生物伦理学委员会批准,批准号为2020H015。1
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主要仪器及试剂 体外转录试剂盒RiboMAXLarge Scale RNA Production System-T7(美国Promega公司,货号:P1300);二级生物安全柜、GENCHECK-1荧光检测仪(杭州众测生物科技公司);……登录APP查看全文
