陈超 李冬 童国俊 胡四平

食管腺癌已成为发病率最高的食管恶性肿瘤，也是生长速度最快、最具侵袭性的恶性肿瘤之一[1-2]。由于目前食管腺癌的预后仍极不理想，探索食管腺癌的发生、发展及预后影响因素是食管腺癌治疗的基础。微小非编码 RNA（microRNA，miRNA）可通过识别 mRNA上的miRNA应答元件抑制mRNA的翻译或导致mRNA降解，同时，长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）上也存在miRNA应答元件并竞争性结合miRNA[3]。因此，lncRNA、miRNA、mRNA之间形成的内源竞争RNA（competing endogenous RNA，ceRNA）网络是食管癌预后机制研究的重要突破点，可能为食管腺癌患者的治疗提供新的方法。癌症和肿瘤基因图谱计划（The Cancer Genome Atlas，TCGA）数据库中包含了大量的肿瘤标本的数据，包括数百例食管恶性肿瘤患者的转录组测序数据及相对应的临床基本信息。然而，关于食管腺癌中的ceRNA网络及其影响预后的机制目前仍知之甚少。本研究提取食管腺癌组织的转录组数据，利用生物信息分析手段构建食管腺癌预后相关的ceRNA网络，以进一步探索食管腺癌预后影响机制，现将结果报道如下。

1 对象和方法

1.1 对象 选择截至2019年7月从TCGA获取78例食管腺癌组织和13例正常食管组织的lncRNA、miRNA、mRNA表达量数据，以及食管腺癌组织患者性别、年龄、病理分期等临床数据。食管腺癌患者男67例，女11例，年龄 68.4（58.0～77.1岁），生存期为 2.15（1.01～4.88）年；按肿瘤病理分期，处于Ⅰ期、Ⅳ期各10例（12.8%），Ⅱ期25例（32.1%），Ⅲ期 33例（42.3%），13例正常食管组织TCGA未提供临床信息。

1.2 方法

1.2.1 差异基因筛选 采用R软件分析食管腺癌组织和正常食管组织中存在差异表达的lncRNA、miRNA、mRNA。差异基因的筛选条件：（1）lncRNA、miRNA的差异倍数（fold change，FC）以2为底的对数的绝对值（|log2FC|）均为≥1；……