重组酶聚合酶扩增检测产志贺毒素大肠埃希菌的微流控芯片技术
2021-06-04范一灵王淑娟李琼琼宋明辉杨美成
范一灵,王淑娟,李琼琼,胡 颖,宋明辉,秦 峰,4,刘 浩,杨美成,*
(1.国家药品监督管理局药品微生物检测技术重点实验室,上海市食品药品检验研究院,上海 201203;2.中国食品药品检定研究院,北京 102629;3.遵义医科大学公共卫生学院,贵州 遵义 563006;4.复旦大学化学系,生物医学研究院,上海 200438)
产志贺毒素大肠埃希菌(Shiga toxin-producingEscherichia coli,STEC)是一类可引起人类腹泻、肠出血、溶血性尿毒综合征、肾衰竭、溶血性贫血以及死亡的食源性致病微生物[1],可存在于水体、植物、动物尤其是反刍动物体内[2]。食品中低于100 CFU的STEC菌体就可能导致人类患病[3]。STEC共有超400 种血清型[4],在非O157:H7血清型的产志贺毒素大肠埃希菌(Non-O157 STEC)中,有6 种被认为是检出率最高、危害较大的菌株,分别是O26(22%)、O111(16%)、O103(12%)、O121(8%)、O45(7%)和O145(5%)[5-6]。美国疾控中心发布的数据显示,2016年美国有5 441 例经确认的STEC感染事件[7],预估有超过26万 名患者,导致30 人死亡[8]。
目前,检测STEC的主要分子靶点是编码志贺毒素的stx基因。该基因主要分为stx1和stx2基因两类[9-10]。其中,stx1基因有3 个亚型,分别为stx1a、stx1c、stx1d;而stx2基因的亚型较多,常见的亚型有stx2a到stx2g共7 种亚型[9,11]。国际上主要采用实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)[12-14]对其进行检测,其中使用较广的国际标准化组织(International Organization for Standardization,ISO)和美国农业部(United States Department of Agriculture,USDA)方法也采用该技术对疑似含STEC的增菌培养物进行初筛[15-16]。然而,real-time PCR方法需要温度在50~100 ℃间不停变化,对相关检测设备要求较高,无法便携携带,较难满足基层实验室和现场快速检测的需求。
近年来,以恒温方式扩增目标核酸的方法被逐步应用于微生物检测领域,给致病菌的核酸快速检测提供了更多选择。……
