全外显子组测序揭示家族性渗出性玻璃体视网膜病变新型LRP5突变的研究
2021-06-04赵汝莲李姝锦杨正林
陈 晨,赵汝莲,彭 丽,李姝锦,4,杨正林,,4
(1.中国科学院成都生物研究所,四川 成都 610041;2.中国科学院大学,北京 100049;3.电子科技大学,四川 成都 611731;4.四川省医学科学院·四川省人民医院,四川 成都 610072)
家族性渗出性玻璃体视网膜病变(FEVR)是一种致盲性疾病,是导致青少年视力损伤的主要原因之一,最早由Criswick和Schepens报道[1]。在本研究中,通过对两个FEVR家族的先证者进行全外显子测序分析以及Sanger测序验证,成功鉴定了两个新的错义突变:c.3503A>G;p.Y1168C和c.4391T>C;p.M1464T。经过荧光素酶报告基因实验,发现本研究鉴定出的两个LRP5基因的新错义突变均使Norrin/β-catenin信号通路活性显著下调,这可能导致FEVR的发生。本研究揭示了FEVR患者的遗传因素,扩宽了LRP5基因的突变谱,为FEVR的分子诊断提供理论依据和新的靶点,从而指导临床。
1 对象与方法
1.1 研究对象选取2019年4月收集的样本资料。罹患FEVR的两个不相关家庭均来自印度Aravind眼科医院。所有受试者均已签署书面知情同意,所有实验均在赫尔辛基宣言的宗旨指导下进行。该研究得到四川省人民医院伦理监督委员会的批准。通过B超、裂隙灯生物显微镜、眼底照相和眼底荧光素血管造影术(FFA)进行FEVR的诊断。所有患者均排除早产,吸氧史或吸毒史。
1.2 DNA提取和全外显子组测序使用DNA提取试剂盒(TianGen,北京,中国)从外周血样本中提取先证者及其家系的基因组DNA样本。家系先证者及相关家系成员的外周血DNA于2019年4月提取完成,存放于-80 ℃,用于后续全外显子测序。使用全外显子组测序技术对两个先证者的DNA样本测序。DNA文库的构建基于Agilent SureSelect Human All Exon V5试剂盒(Agilent Technologies,Santa Clara,CA,USA)。文库……
