基于生物信息学分析筛选肾透明细胞癌潜在预后生物标记物G蛋白信号调节因子3*
2021-05-29刘小雨杨海波
刘小雨,杨海波,张 倩,赵 语△
(1.重庆医科大学附属大学城医院药学部,重庆 401331; 2.中国人民解放军陆军军医大学第二附属医院药学部,重庆 400037)
肾细胞癌是常见的泌尿系统恶性肿瘤,其发病率呈逐年上升趋势[1],根据病理类型分为肾透明细胞癌(KIRC)、肾乳头状细胞癌(KIRP)、肾嫌色细胞癌(KICH)等,其中KIRC是最常见的病理亚型,约占75%[2]。早期KIRC主要通过手术治疗,晚期及转移性KIRC主要采用靶向治疗,但以上方法在延缓肿瘤进展、提高生存率等方面作用仍有限[3]。近年来,靶向程序性死亡受体1(PD-1)/程序性死亡配体1(PD-L1)、细胞毒性T细胞相关抗原-4(CTLA4)的免疫疗法已用于KIRC的治疗,但仅部分患者能从中获益。KIRC中存在高水平巨噬细胞、淋巴细胞等免疫细胞的浸润,且免疫细胞的浸润水平对KIRC患者的预后有重要调控作用[4-5]。因此,肿瘤免疫浸润水平影响肿瘤患者的预后[6]。研究KIRC浸润相关免疫基因并筛选免疫浸润标记物,对于改善KIRC的预后有重要意义。G蛋白偶联受体信号通路参与肿瘤的发生与发展[7],G蛋白信号调节因子3(GPSM3)是G蛋白偶联受体信号调节因子[8],可促进肿瘤的发生与发展[9],但GPSM3在KIRC中的具体作用尚不清楚。本研究中利用多种生物信息学数据库研究GPSM3在KIRC中的表达情况及与预后的相关性,以及对肿瘤免疫浸润的影响,寻找KIRC潜在判断预后的标记物。现报道如下。
1 数据库选择与分析方法
1.1 GPSM3在不同类型肿瘤组织中的差异表达分析
肿瘤免疫评估(TIMER)数据库(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)是综合分析多种肿瘤与免疫细胞浸润水平相关性的数据库,可用于分析GPSM3在不同类型肿瘤组织中的表达。……
