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呼吸系统疾病生物样本采集保藏管理技术标准和规范

2021-05-25国家呼吸系统疾病临床医学研究中心生物样本库专家组

中国医药导报 2021年12期
关键词:清液液氮储存

国家呼吸系统疾病临床医学研究中心生物样本库专家组

生物样本作为基础及临床研究的宝贵资源,对推进临床诊疗能力、提高精准医学研究水平都具有重要的现实意义[1]。我国呼吸系统疾病生物资源库建设尚处于初级阶段,普遍缺乏标准化操作流程[2]。除通用样本,例如血液、尿液、手术病理组织外,呼吸系统疾病特有样本还包括痰液(包括诱导痰)、胸腔积液、支气管肺泡灌洗液(BALF)、咽拭子浸液、支气管黏膜活检组织以及针刺活检组织等。同时,还应注意感染性疾病样本具有传染性。因此,样本采集和保藏时应区别对待,并遵循相应标准操作规程。本文重点阐述呼吸系统疾病生物样本采集、保藏、管理技术标准和规程。

1 标准操作规程

生物样本采集保藏应遵循的流程[3]:①知情同意。②登记临床信息,打印条码。③采集样本。④入库前处理。⑤入库登记。⑥入库储存。⑦管理、质控。⑧申请出库、科学研究。

1.1 血液样本采集和保藏

1.1.1 准备

运输箱、采血针,真空采血管。常用采血容器用途见表1。

表1 常用采血管用途

1.1.2 采集

抗凝管、非抗凝管各1 管(5 mL)。

1.1.3 处理

1.1.3.1 血浆 ①分离:离心力815 g,10 min,4℃。②提取:取上清液。③二次离心:离心力2500 g,10 min,4℃。④分装:取上清液[4]。

1.1.3.2 血清 ①凝血:30 min,室温。②离心:离心力1500 g,10 min,4℃。③分装:取上清液[4]。

1.1.3.3 血凝块 ①分离:分离血清。②混匀:无菌玻璃棒混匀。③分装:2 支冻存管(血凝块体积1 cm3)[5]。

1.1.3.4 白细胞 ①分离:a)预热:淋巴细胞分离液、RPMI1640 培养液至室温。b)提取:加入RPMI1640(1∶1)。c)铺血:加入淋巴细胞分离液(3 mL)。d)离心:离心力450 g,30 min,室温。e)吸取:白膜至5 mL 磷酸盐缓冲液(PBS)离心管。f)离心和洗涤:离心力450 g,1 min,室温;弃上清液,加入5 mL PBS 再次洗涤、离心。②程控降温仪处理:a)混匀:弃上清液,加冻存剂保护液3 mL。b)分装:3 支冻存管中(每支1 mL)。c)降温:每分钟降1℃,直至-80℃。或RNAlater 处理:a)混匀:弃上清液,加入3 mL RNAlater。b)分装:3 支冻存管中(每支1 mL)。c)过夜:置4℃冰箱。见图1。③注意事项:a)处理时间<1 h。b)离心机自然降速。c)无菌操作。d)冻存剂保护液预先配置并冷冻,后续置于冰上操作[6]。

图1 白细胞处理流程图

1.1.4 保藏

①全血:-80℃。②血清、血浆:液氮气相或-80℃。③血凝块:-80℃。④白细胞:-80℃[6]。血液标本采集和保藏流程见图2。

图2 血液标本采集及保藏流程图

1.2 尿液样本收集和保藏

1.2.1 准备

清洁外阴;使用合格容器。

1.2.2 收集

按要求收取样本[7](表2),具体流程见图3。

表2 常用尿液样本种类

图3 尿液样本采集和保藏

1.2.3 处理

立即送检,不能立即可置于2~8℃保存。

1.2.4 保藏

①短期:4℃冰箱。②长期:含防腐剂容器,-20℃冰箱[8]。防腐剂添加见表3。

表3 尿液样本防腐剂添加

1.2.5 注意事项

①晨尿为宜。②婴幼儿可用黏附剂收集袋。③容器材质透明、稳定。④注明标记。⑤避免污染。⑥运输、保藏需避光。

1.3 痰液样本采集和保藏

1.3.1 准备和采集

①询问症状及肺功能。②沙丁胺醇气雾剂:适用于一秒用力呼气容积(FEV1)60%~80%,且无气促者,雾化前10 min,400 μg。③高渗盐水雾化:单一浓度法(3%或4.5%)或梯度浓度法(3%、4%、5%);雾化10 min后漱口、擤鼻、咳嗽;FEV1<60%或存在气促无需雾化[9]。

1.3.2 处理

1.3.2.1 痰上清液 ①采集:痰栓。②称重。③孵育:加入8 体积杜氏磷酸盐缓冲液(D-PBS)。④涡旋:15 s,冰上孵育15 min。⑤离心:790 g,4℃,10 min。⑥分装:取上清液,等分。

1.3.2.2 细胞涂片 ①采集并称重。②孵育:加入4 体积的0.1%二硫苏糖醇,涡旋15 s,冰上孵育15 min。③过滤:300 目滤布。④灌板计数:台盼蓝染色方法计数。⑤离心:790 g,4℃,10 min。⑥制片:涂片2 张,室温风干,甲醛固定。

1.3.2.3 细胞团块 ①混合:细胞悬液1 mL 转移至含2 mL 核糖核酸酶微量离心管。②离心:400 g,4℃,5 min,弃上清液。③悬浮:500 μL RNAlater 细胞试剂悬浮细胞团块[9]。

1.3.3 转运及保藏

①痰上清液、细胞团块:“干冰”低温运送,-80℃下储存。②细胞涂片或细胞离心涂片:室温下运送、储存。见图4。

图4 诱导痰/痰留取、处理、保藏流程图

1.3.4 注意事项

如未能及时处理,样本置于4℃,放置时间<2 h。

1.4 组织病理(含支气管黏膜及TBNA)样本采集和保藏

1.4.1 组织样本处理

1.4.1.1 准备及采集 ①清洗。②取材:病变及对照组织。③切割:根据需要,选择快速冰冻、RNAlater 保存、石蜡包埋和最佳切割温度(OCT)包埋等中一至数种。④记录:病理诊断和处理方法。

1.4.1.2 处理方法 ①快速冰冻:处理流程参见《组织样本快速冰冻》[10]。②RNAlater 处理:处理流程参见《组织样本RNAlater 处理》[10]。③OCT 包埋:处理流程参见《组织样本OCT 包埋及冰冻切片制作》[10]。④石蜡包埋:处理流程参见《组织样本石蜡包埋及石蜡切片》[10]。

1.4.2 组织样本保藏

①快速冰冻:冻存管,液氮气相环境。②OCT 包埋:冻存管,-80℃。③冰冻切片:切片盒,-20℃。④石蜡包埋:干燥、室温。⑤石蜡切片:切片盒,干燥、室温[10]。采集与储存流程见图5。

图5 组织病理样本采集和保藏流程

1.5 BALF 样本采集和保藏

1.5.1 准备

①评估操作风险。②预热灌洗液(蒸馏灭菌水,37℃)。③样本罐置于冰上。

1.5.2 采集

①部位:病变段,弥漫性病变选择右肺中叶或左上肺舌段。②灌洗量:每次25~50 mL,总量60~120 mL。③回收:50~100 mmHg 负压吸引,回收率≥30%。④过滤:回收液置于冰上。双层无菌纱布过滤,装入灭菌容器,记录总量[11]。操作流程见图6。

图6 肺泡灌洗液留取、处理、保藏流程图

1.5.3 处理

1.5.3.1 BALF 上清 ①转移:10~15 mL 至离心管,剩余液体转移至50 mL 管。②离心:1000 g,4℃,5 min。③提取:留取上清液。④储存:保留为10×1 mL 等份和1×50 mL,标注。

1.5.3.2 沉渣涂片 ①提取:离心所得细胞沉淀。②混匀:添加生理盐水,混匀。③离心:转移60 μL 细胞悬液至4 个细胞离心涂片机每一个的漏斗,1000 g,5 min,4℃。④调整:显微镜下调整浓度。⑤制片:染色2 片;另外2 玻片完成第一步固定。使用Shandon 差异-快速试剂盒[11]。

1.5.4 保藏

①上清液:-80℃。②细胞涂片或离心涂片:室温[12]。

1.5.5 注意事项

①内镜顶端紧密楔入支气管开口。②麻醉充分。③无菌操作。④大气道病变,第一管回收液单独处理,非大气道疾病可混合后分送。

1.6 胸腔积液样本采集和保藏

1.6.1 采集

按诊疗常规胸腔穿刺留取[13]。

1.6.2 处理

①第一管微生物培养,第二管常规检查,第三管生化检查,第四、五管样本储存。②如不能送检可加入乙醇固定,病理和细胞学检查采用EDTA 盐抗凝,化学检查采用肝素抗凝。③无菌操作[14]。

1.6.3 保藏

①-40℃或-80℃冰箱。②冻融后不能再次入库。③每3 个月抽样检测[14]。采集与储存流程见图7。

图7 胸腔积液留取、处理、保藏流程图

1.7 鼻咽拭子样本采集及保藏

1.7.1 准备

评估口鼻咽或口咽部情况。

1.7.2 采集

1.7.2.1 咽拭子 无菌拭子左右两面及拭子头部刮取扁桃腺两侧及咽后壁的分泌物[15]。

1.7.2.2 鼻拭子 无菌拭子以垂直面部的方向轻轻插入鼻道内鼻腭处,停留15~30 s,轻轻旋转3 次,缓慢退出[16]。

1.7.3 处理

①拭子头部折断后置于装有病毒运送液的螺口塑料试管。②试管口及棉签塞火焰上消毒后旋紧。③摇动试管,混匀。

1.7.4 转运

4℃环境。

1.7.5 保藏

①储存<48 h:4℃冰箱。②储存>48 h:-70~-80℃冰箱。

1.7.6 注意事项

①进食2 h 内勿采集。②样本容器无菌、干燥。③真菌培养须采集溃疡表面分泌物。

1.8 唾液样本采集及保藏

1.8.1 准备

①禁食1 h。②清水漱口。③漱口后等待10 min。④牙龈或口腔出血不宜留取。

1.8.2 采集

1.8.2.1 混合性唾液 ①弃去最初唾液,留取后续唾液2 mL。②舌下放置干燥脱脂纱布,10 min 后取出,挤出唾液备用[17]。③商业用唾液收集管(遵循相关说明书)。

1.8.2.2 单一腺体唾液 ①腮腺唾液:口腔科医生采集。②颌下腺唾液:塑料吸盘固定于舌下腺区收集[17]。

1.8.3 处理

①-20℃冰箱。②4℃环境中≤2 h。

1.8.4 保藏

>6 个月,-80℃[17]。

1.9 高致病性样本采集和保藏

1.9.1 样本采集

①呼吸道:72 h 内采集。②血液:急性期尽快收集,恢复期在发热后3 周内收集。③尿液:置于无菌密闭容器,安全加盖并封以石蜡。④胸腔积液:置于无菌塑料螺口管。⑤肺组织活检:在超声或X 线定位下,经皮穿刺取肺组织活检样本,置于含3 mL 采样液的塑料螺口管中。

1.9.2 样本包装

①生物安全Ⅱ级实验室生物安全柜内分装成一式三份:一份当地检测用,一份送第三方检测,一份储存以备复核[18]。②每件塑料袋密封一份样本。③填写“疑似人感染高致病性疾病/不明原因肺部感染样本送检单”,用塑料袋密封。④注意事项:a)收集容器带螺旋盖,内有垫圈、耐冷冻,密封性好。b)样本外泄需立刻用消毒毛巾擦拭,后用安尔碘消毒液反复擦拭5 遍以上。c)采集者需Ⅱ级以上防护;如防护用品受污染,应立即更换。d)所有样本均需注明姓名、床号、ID 号及收集日期。e)长途转运需4℃保存。f)一次性采集器械用后即焚烧销毁[19]。

1.9.3 样本保藏

①24 h 内置于4℃保存;24 h 内无法检测置于-70℃或以下储存;如无-70℃储存条件,则于-20℃储存。②血清4℃保存3 d、-20℃以下长期储存。③储存地点应符合传染病规范,设立专库或专柜单独储存[20]。采集及保藏流程见图8。

图8 高致病性样本留取、处理、保藏流程图

2 样本入库管理规程

2.1 目的

规范储存管理,保证储存质量。

2.2 适用范围

长期储存样本。

2.3 人员职责

负责样本入库,对储存容器和设备进行监督管理。

2.4 设备要求

①室内温度、湿度。②氧含量监测报警装置。③照明调节设施。④消防设施。⑤应急电路。⑥门禁系统。⑦紧急处置预案。⑧紧急联系人名单[21]。

2.5 入库任务

①样本质量控制。②确保样本位置唯一性和可溯源性。③实时反映样本位置信息。

3 在库样本管理和质量控制

3.1 目的

正确、安全地储存样本。

3.2 适用范围

保证样本储存质量,确保样本储存位置正确。

3.3 人员职责

核实库存,确保信息正确。

3.4 库存核实

①至少一年一次。②随机选取至少1‰新入库样本量。③安全储入控制措施。④安全防护措施。⑤避免样本损耗。⑥核实后样本归位。⑦记录结果。⑧更正错误信息及数据。⑨记录纠错措施,填写分析报告[21]。

3.5 冷链系统管理和维护

冷链由基础设施、储存设备、冻存耗材、监控设备等构成[22]。

3.5.1 基础设施

①冰箱与液氮设备分开放置。②冰箱背靠墙,或间隔15 cm 以上背对背摆放。③配置备用电源。④重要样本需备份,并分开放置。

3.5.2 储存设备

①-80℃储存设备(超低温冰箱)。②-140℃储存设备(液氮气相):需备液氮自动检测设备和自动加注设备。③-196℃储存设备(液相液氮罐和液氮储存箱)。

3.5.3 监控设备

包括冰箱温度探头、冰箱运行温度记录,液氮容器液位监控、远程报警、视频监控等。

3.5.4 冻存耗材

建议使用带有螺纹密封的冻存管,外旋冻存管适用于超低温冰箱,内旋冻存管适用于液氮气相或深冷冰箱。

4 样本出库管理规程

4.1 目的

确保样本及其信息的出库符合规定。

4.2 需用材料

液氮、干冰、样本盒、手套。

4.3 参与人员

资源库技术员、管理员、样本用户。

4.4 所需条件

①提交申请。②审核批复。③签署协议。④信息跟踪。⑤信息隐私化。

4.5 审批程序

①申请方提出申请,管理方登记“发放单”。②申请批准后,管理方批准“发放单”。③管理方查询样本加入“发放单”。④管理方移交样本。⑤申请方签收,管理方确认“发放单”。

5 样本运输标准操作规程

5.1 样本运输程序

发货方与收货方书面确认:①发货通知单。②发货清单。③物流跟踪。④收样确认。⑤审查包装测试报告。⑥送样测试。

5.2 样本运输条件

5.2.1 法规要求

①符合国际、国内法规。②参与运送员工具备资质。

5.2.2 环境要求

①温度要求:a)20~30℃:隔热包装。b)2~8℃:冰块或凝胶袋(-15℃)。c)-20℃:冷冻凝胶袋(-20℃或-20℃以下)。d)-70℃:干冰颗粒、干冰块、干冰片。包装贴上危险物品标识符。e)≤-150℃:干燥液氮罐运输。②湿度要求:湿度敏感样本,需加入干燥剂。③时间要求:交由具备资质的快递公司。④数量要求:分为多个小包装运输,备充足冷冻剂[23]。

5.2.3 注意事项

①样本置于冷冻剂间。②剩余空间用塑料泡沫填充。③清除残留标签。④运输容器定期消毒。⑤空运单不可重复使用。

5.3 国际运输

①了解接收国家法律、法规。②预估运输时间。③雇佣有资质货代公司或快递公司。④遭遇延误,可委托快递公司补充冷冻剂。

6 样本销毁管理

包括生物样本和相应材料的销毁,销毁样本符合法律法规要求[24]。

6.1 申请销毁

①提出申请,附销毁质检报告,第三方随机抽检复核。②申请批准后,由第三方销毁。

6.2 实施销毁

①核对待销毁样本。②将样本连同容器放入防生物危害销毁袋,移交第三方。③记录销毁原因、批准和执行时间及执行人员。④删除样本数据,保留知情同意撤销申请和样本销毁记录。

7 科学研究

样本使用要做到资源共享,物尽其用;科学研究后样本如有剩余,对于可反复使用的样本,在确保未被污染及可再用情况下,应运回资源库再次入库;对于不可反复使用的样本,不能再次入库。

执笔:丁永杰,罗文婷,李庆云,郑劲平。

专家组成员(按姓氏拼音排列):丁永杰(上海交通大学医学院附属瑞金医院,上海交通大学医学院呼吸病研究所),顾文超(上海市浦东新区人民医院),郝创利(苏州大学附属儿童医院),黄树栋(阳江市人民医院),李国平(成都市第三人民医院),李庆云(上海交通大学医学院附属瑞金医院,上海交通大学医学院呼吸病研究所),李雪琴(山西晋城无烟煤矿业集团有限责任公司总医院),刘恩梅(重庆医科大学附属儿童医院),刘光辉(武汉大学中南医院),刘清华(梅州市人民医院),卢震辉(宁夏医科大学总医院),罗文婷(广州医科大学附属第一医院,国家呼吸系统疾病临床医学研究中心),邱晨(深圳市人民医院),任蕾(上海市第四康复医院),荣光生(合肥市第三人民医院),孙云(银川市妇幼保健院),田东波(广州医科大学附属第六医院),王琪(大连医科大学附属第二医院),魏春华(潍坊卫恩医院),魏立平(广州医科大学附属第三医院),余咏梅(昆明医科大学附属第一医院),张宏(甘肃省人民医院),张淇钏(汕头市中心医院),张蓉芳(甘肃省妇幼保健院),张玉焱(惠阳三和医院),赵冰融(中南大学湘雅医院),郑劲平(广州医科大学附属第一医院,国家呼吸系统疾病临床医学研究中心),郑智远(中南大学湘雅医院)。

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