间隔区寡核苷酸DNA微阵列分型在结核分枝杆菌检测中的应用

2021-05-18杨建伟王少华杨卫华杨俊梅

新乡医学院学报 2021年4期

关键词：检测

杨建伟，李辉，王少华，杨卫华，杨俊梅

(1.河南省儿童医院，郑州儿童医院，郑州市儿童感染与免疫重点实验室，河南郑州 450018；2.河南省疾病预防控制中心，河南郑州 450016；3.江苏猎阵生物科技有限公司，江苏如东 226499)

结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,MTB)是引起结核病的病原菌，可侵犯全身器官，其中以肺结核最为常见。我国是结核病高发国家之一，结核病负担居全球第3位[1-2]。分子生物学技术结合流行病学调查形成了现代分子流行病学。分子分型技术是结核病分子流行病学的主要方法之一，可通过对MTB基因型鉴定而监测结核病暴发流行、传染源传播链追踪及实验室污染等，还可为结核病传播模式的建立提供数据支持[3-4]。近年来，研究者建立了多种MTB基因分型技术，IS 6110为基础的限制性片段长度多态性(IS 6110 Restriction Fragment Length Polymorphism,IS 6110-RLFP)[5]、多位点可变数目串联重复序列分析(multiple loci variable number tandem repeat analysis,MLVA)[6-7]和间隔区寡核苷酸分型(spacer oligonucleotide typing,Spoligotyping)[8-9]被广泛应用，其中Spoligotyping是公认的MTB一线分型方法。Spoligotyping是以聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)为基础，检测MTB基因组中直接重复区(direct repeat,DR)的基因分型方法，Spoligotyping通过识别间隔子的PCR产物来确定DR是否存在,在MTB基因分型中其具有效率高、识别力强和快速的特点[10]。目前，国际上已经建立了MTB Spoligotyping基因分型数据库SITVIT2(http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_ONLINE/)，该数据库包含世界各地MTB的Spoligotyping 分型结果，可供比对研究，将Spoligotyping分型结果与数据库比较就能获得不同MTB的间隔区寡核苷酸分型国际分类号(spoligotype international type,SIT)和基因型家族[11-13]。本研究旨在探讨间隔区寡核苷酸DNA微阵列法在MTB基因分型检测中的应用价值。