糖皮质激素对晶状体上皮细胞生物学功能调控作用的生物信息学分析
2021-05-12闫楚凡韩笑张劲松
闫楚凡 韩笑 张劲松
中国医科大学附属第四医院眼科,沈阳 110059
糖皮质激素性白内障多见于全身或局部长期使用糖皮质激素者,其发病机制尚未完全阐明。许多生物学过程被证明与糖皮质激素性白内障的发生相关,如细胞分化异常和糖皮质激素受体(glucocorticoid receptor,GR)的激活等[1-3];糖皮质激素还导致晶状体中E钙黏附蛋白和N钙黏附蛋白的表达量下降,而细胞黏附在晶状体上皮细胞(lens epithelial cells,LECs)的正常分化和迁移中有重要作用[4]。微小RNA(microRNA,miRNA)是一种长度为18~22个核苷酸的非编码RNA,与基因的3’端非翻译区结合,通过抑制基因的转录来影响蛋白的表达。既往研究发现,miR-29a可以靶向抑制GR mRNA的表达,同时其本身的表达量又依赖于GR的激活,形成一个负反馈回路,这个特点在糖皮质激素治疗过程中有助于减缓GR水平的逐渐降低[5],这为糖皮质激素性白内障的治疗提供了新的思路。目前关于miRNA与糖皮质激素性白内障的研究尚未见报道。本研究基于生物信息学方法分析经地塞米松处理的LECs中差异基因的表达及其相关的生物学功能,筛选并验证hub基因的表达,预测与其最有可能相关的miRNA,以期为白内障的治疗提供参考。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1细胞来源 人LECs细胞株HLE-B3细胞购自美国ATCC公司。
1.1.2主要试剂及仪器 地塞米松、Trixon X-100(北京索莱宝科技有限公司);二甲基亚砜(dimethyl sulfoxide,DMSO)(美国Sigma公司);MEM培养液、胰蛋白酶、磷酸盐缓冲液(phosphate buffered saline,PBS)(江苏凯基生物技术股份有限公司);胎牛血清(澳洲AusGeneX公司);青链霉素混合液(美国HyClone公司);RNA iso Plus、实时荧光定量PCR试剂盒(日本TaKaRa公司);……
