环境化学物暴露对妊娠期糖尿病生物信息学的影响
2021-05-08刘素琴崔静孙健平隋树淼
刘素琴,崔静,孙健平,隋树淼
1 青岛市妇女儿童医院,山东青岛266011;2 青岛市疾病预防控制中心 青岛市预防医学研究院;3 莱西市院上中心卫生院
妊娠期糖尿病(GDM)是在妊娠期间发生的自发性高血糖,是一种常见的妊娠并发症[1]。尽管分娩后GDM 症状体征会消退,但其对母亲及儿童的健康可产生长远影响,并导致肥胖和糖尿病的代际恶性循环[2-3]。据国际糖尿病联盟估计,2019年全球有2 040 万20~49 岁的女性受GDM 影响,其患病率高达15.8%,且报道GDM 患病率随着年龄增加而增长,45~49 岁 女 性 中GDM 的 患 病 率 更 是 高 达37.0%[4]。研究显示,GDM 受遗传、营养及生活方式等诸多因素影响[5];但这些因素并不能完全解释GDM 流行的严重性,越来越多的证据显示环境化学物与GDM 的发生密切相关[6]。环境化学物广泛存在在空气、水和食物中,砷、环境细颗粒物、双酚A及其代谢物、持久性有机污染物等均影响GDM 的发生发展[7-10]。目前虽然已经有了部分环境化学物对GDM 影响的研究,但是尚无二者交互作用分子层面全面而深入的报道。因此本研究采用生物信息学方法分析环境化学物质对GDM 影响的分子机制,为GDM的预测与防治提供理论依据。
1 资料与方法
1.1 GDM 共同关联基因筛选 2021年1月19日以“gestational diabetes mellitus”,“Homo sapiens”[porgn:__txid9606]为检索词在Pubmed 的Gene Expression Omnibus(GEO)数据库进行检索,共检索到14个可能与GDM 关联的基因芯片,将检索到含有非GDM 和GDM 样本的基因芯片纳入本研究。采用GEO2R对基因芯片中的非GDM组和GDM组的基因样本进行中位数标准化分析,选取非GDM 组与GDM 组分别处在同一水平的基因芯片中的基因样本导出后,筛选出P<0.05 且∣lg FC∣>1 的基因纳入本研究。……
