运用SNP芯片评估马身猪保种群体的遗传结构
2021-04-27蔡春波张雪莲张万峰高鹏飞郭晓红李步高曹果清
畜牧兽医学报 2021年4期
蔡春波,张雪莲,张万峰,杨 阳,高鹏飞,郭晓红,李步高,曹果清
(山西农业大学动物科学学院,太谷 030801)
遗传多样性是指一个物种遗传组成中遗传特征的总数。遗传多样性在群体适应环境变化的过程中起着十分重要的作用,群体的遗传多样性越丰富,其适应环境变化的能力越强,生存能力也就越强[1-3]。SNP是最常见的一种遗传多样性,其数量多,而且分布密集。通过比较分析种群内个体的SNP位点,可以鉴定种群的遗传多样性、亲缘关系和家系结构[4-5]。SNP芯片即单核苷酸多态性微阵列,是将数百万个DNA标记序列排列并固定在特殊的硅片上,形成SNP探针微阵列[6]。SNP芯片的工作原理是通过固定在芯片上的DNA标记序列与目标基因组发生碱基互补配对反应,从而精准地鉴定目标基因序列中的SNP位点。随着SNP芯片价格的降低和筛选速度的加快,SNP芯片技术的使用越来越广泛,已经成为鉴定SNP位点最为高效的技术[7]。在猪种质特性和群体遗传多样性的研究中,SNP芯片技术的应用也非常广泛[8-9]。Wang等[10]利用SNP芯片技术检测了6个太湖猪群体的SNP位点,分析了6个太湖猪种群的遗传多样性,结果表明,梅山猪的遗传多样性最丰富,枫泾猪的遗传多样性最低。黄树文等[11]利用SNP芯片技术分析了广东地方猪种的遗传多样性,结果表明,两广小耳猪、大花白猪和蓝塘猪的遗传多样性都比较低,需要引入新的血统,扩大其遗传多样性。
马身猪是山西省地方猪种,属于黄淮海黑猪类型,具有优良的种质特性。……
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