小鼠骨骼肌纤维类型定量PCR 内参基因的筛选
2021-04-26张静熊燕华永琳郭玉熊显荣字向东李键
张静 熊燕 华永琳 郭玉 熊显荣 字向东 李键
(1. 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,成都 610041;2. 西南民族大学畜牧兽医学院,成都 610041)
不同部位骨骼肌代谢方式及功能存在较大差异,并且骨骼肌在运动、损伤等生理病理条件下,根据不同的代谢和功能需求进行持续的重塑[1]。对于家畜而言,不同的肌纤维类型组成,将影响家畜肉品质。骨骼肌的这些差异主要是由于肌纤维类型的组成不同。因此,检测骨骼肌纤维类型的组成对于研究骨骼肌的功能及家畜肉品质显得尤为重要。目前已经使用多种标准对肌纤维进行分型,包括组织化学方法[2]、收缩速度[3]、疲劳性、显性酶途径和肌球蛋白重链(Myosin heavy chain,MyHC 或Myh)亚型表达[4]。其中MyHC 亚型是肌纤维类型的分子标记,检测MyHC 亚型表达是最常用的分类标准。小鼠的肌肉纤维含有4 种MyHC 异构体,分别为I 型(Myh7),IIA 型(Myh2),IIB(Myh4)型 和IIX 型(Myh1),单根肌纤维通常表达单个MyHC 异构体[5-6]。其中I型纤维收缩速度慢,被称为慢肌纤维,以氧化代谢产生能量。IIB 型和IIX 型纤维收缩速度快,被称为快肌纤维,主要通过糖酵解途径代谢葡萄糖。IIA 型纤维为中间型纤维,收缩速度快,属于糖酵解/氧化磷酸化混合代谢类型[7]。近年来,为了从RNA水平研究肌肉组织肌纤维类型差异变化,阐明肌肉代谢和功能的分子机制,普遍采用灵敏度高,特异性好的逆转录荧光实时定量PCR(RT-qPCR)技术。
使用RT-qPCR 方法检测RNA 表达时,控制实验误差至关重要。目前RT-qPCR 检测技术以稳定的内参基因为参照,检测基因的相对表达量,降低实验误差对分析结果的影响[8]。……
