中国广西地区格特隐球菌菌种复合体的基因型分析
2021-04-25李炳坤黄春阳李秀楹郑艳青潘开素廖万清曹存巍
李炳坤 黄春阳 李秀楹 郑艳青 潘开素 廖万清 曹存巍
(1.广西医科大学第一附属医院皮肤性病科,南宁 530021; 2.南宁市第四人民医院,南宁 530023; 3.上海长征医院皮肤性病与真菌病研究所,上海 200003)
隐球菌是自然界中威胁人类和动物生命的真菌病原体[1]。通常是人体吸入空气中的孢子或者酵母细胞进而进入呼吸道,然后传播到中枢神经系统,引起肺隐球菌病和隐球菌脑膜脑炎[2-3]。既往有大量的分子生物学方法已经证明在隐球菌中存在相当大的遗传异质性,且各种分子生物学技术已被用于隐球菌的基因分型研究,包括 PCRM13指纹分析、 AFLP、RAPD、 MLMT、多位点序列分型(MLST)和二代测序(NGS)分析[3-4]。格特隐球菌菌种复合体分为C.gattiisensustricto(AFLP4/VGI),C.deuterogattii(AFLP6/VGII),C.bacillisporus(AFLP5/VGIII),C.tetragattii(AFLP7/VGIV) andC.decagattii(AFLP10/VGIV)[5]。
隐球菌病主要由新生隐球菌和格特隐球菌菌种复合体感染所致,由新生隐球菌感染引起的隐球菌病全国各地均有发生,而格特隐球菌菌种复合体感染所致的隐球菌病最初被认为是一种地方性疾病,好发于热带地区。近年来格特隐球菌菌种复合体感染在我国报道逐年增多[6],然而其相关研究的数据比较少,这些分离株的遗传同一性和变异性,以及临床分离株和全球分离株之间的系统发育关系还有待进一步研究。本研究旨在进一步了解广西地区格特隐球菌菌种复合体的基因型,并分析它们与全球菌株的亲缘关系以及相应的抗真菌药物敏感性。
1 材料和方法
1.1 实验菌株
选取2014—2018年从临床患者收集的120株隐球菌菌株,其中10株分离自广西医科大学第一附属医院,另外1株分离自广西壮族自治区人民医院。……
