长链非编码RNA PCA3在胃癌中的预后价值及对胃癌细胞株AGS细胞生物学特性的影响
2021-04-22姜华基崔磊杜玉玉党胜春
姜华基,崔磊,杜玉玉,党胜春
根据世界卫生组织最新统计数据,2018年胃癌发病率和病死率分别位居全球恶性肿瘤的第五位和第三位[1-2]。因早期症状隐匿及缺乏特异性肿瘤标志物,多数胃癌患者被检出时已进展至中晚期,以至于错过了最佳治疗时间[3-4]。因此,探索早期诊断的有效标志物及新的治疗靶点,对促进胃癌诊疗,提高患者预后具有重要意义。
长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)为长度超过200个核苷酸的RNA分子,其本身不具备编码蛋白的能力,但在多细胞生物的生长和发育过程中发挥着调控作用[5-6]。大量研究证实,LncRNA与胃癌在内多种恶性肿瘤的发生发展、侵袭转移、耐药及预后密切相关[7-9]。进一步了解胃癌相关LncRNA的表达和作用机制将有助于开发早期筛查及预后评估标志物,为胃癌靶向治疗提供新的思路。
前列腺癌抗原-3(prostate cancer antigen-3,PCA-3),又名DD3,是位于人类第一号染色体上9q21-22处的一条LncRNA,包括4个外显子和3个内含子,长度为3735 bp[10]。本次研究首先通过癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和基因型-组织表达数据库(genotype-tissue expression,GTEx),分析PCA3在胃癌组织和正常样本中的表达,使用生存分析探索其预后价值并分析其与临床资料的相关性。采用肿瘤免疫评估资源(tumor immune estimation resource,TIMER)数据库分析PCA3在免疫浸润物中的表达及对胃癌患者生存预后的影响,并从体外细胞水平探讨PCA3对胃癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。
1 材料和方法
1.1 材料
胃癌细胞株(AGS、MKN-45和HGC-27)以及正常人胃上皮细胞系GES-1均来自于中国科学院上海生物科学研究所。RPMI 1640(美国Invitrogen公司),胰酶、10 %的胎牛血清(美国Gibco公司)。……
