环状RNA在胃癌研究中的意义*
2021-04-08综述蒋鹏程审校
曹 萱,张 徐 综述,蒋鹏程 审校
(1.江苏大学附属人民医院普外科,江苏镇江 212002;2.江苏大学医学院,江苏镇江 212000)
1 环状RNA(circRNA)的背景
circRNA最初是在植物病毒中被发现[1],由于其是共价闭合且无5′帽子结构和3′末端poly(A)尾巴的环状结构,加之当时的技术限制,一直被认为是错误拼接的产物[2]。随着高通量RNA测序(RNA-seq)技术和生物信息学分析的发展和应用,科学家们检测出越来越多的circRNA,同时发现其参与了多种疾病的发生发展,特别是在恶性肿瘤领域。
2 circRNA的类型及形成机制
circRNA根据来源可为3类:外显子circRNA、内含子circRNA和外显子-内含子circRNA。不过目前,circRNA的成熟机制尚不完全清楚。推测外显子circRNA是经历反向剪接而形成的[3]。目前有3种假说模型解释外显子circRNA的形成:第1种是套索驱动的环化,第2种是内含子配对驱动的环化,第3种是RNA结合蛋白(RBP)介导的环化[4]。
3 circRNA的特点
大多数circRNA是外显子circRNA。外显子circRNA主要存在于细胞质中,而少部分内含子circRNA和外显子-内含子circRNA则在细胞核中[4]。目前circRNA还被证实有以下特点:(1)多样性及丰富性:广泛存在于真核细胞中,种类繁多[5];(2)稳定性:circRNA与线性RNA不同,是不带有5′帽子结构和3′末端ploy(A)尾巴的单链、共价闭环结构。该结构可能保护其不易被RNA外切酶(RNaseR)降解,从而比线性RNA具有更高的稳定性[6];(3)保守性:circRNA在不同物种中高度保守[7];(4)特异性:主要表现在细胞类型特异性及组织特异性[8]。
4 circRNA的功能
其主要功能是除了充当内源性竞争RNA(competing endogenous RNA,ceRNA),或与miRNA结合,在细胞中起到分子海绵的作用外,还有与RBP相互作用等,近年还发现部分circRNA可以编码蛋白。随着大量的研究发现,circRNA在心血管疾病、阿尔兹海默症、癌症等各种疾病的发生发展中起着重要的作用。……
