基于生物钟基因的胃癌预后风险评估模型的建立
2021-04-06金悦卢文卿包博文郑雪莹佟笛车晓芳
金悦,卢文卿,包博文,郑雪莹,佟笛,车晓芳
1 中国医科大学附属第一医院,沈阳110001;2 辽宁省肿瘤药物与生物治疗重点实验室;3 辽宁省恶性肿瘤临床医学研究中心
胃癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,发病率、病死率高[1],多数患者确诊时已为晚期,预后较差[2]。因此,构建准确的预后预测模型对于评估胃癌患者预后、筛选预后不良的高危人群以尽早治疗、提高生存率具有重要意义。昼夜节律是生命体以24 h 为周期的活动[3-4],昼夜节律的产生是由多种生物钟基因所调控的,包括CLOCK、PER1、PER2、PER3、CRY1、CRY2、TIMELESS、BMAL1、DEC1、DEC2、NPAS2和RORA 等。这些生物钟基因在不同恶性肿瘤中发挥着不同的作用。生物钟基因在胃癌中的研究较少,且大部分研究仅探索了生物钟基因表达与胃癌的关系,对于多种生物钟基因如何影响胃癌预后尚不明确。同时,因未综合考虑所有生物钟基因在胃癌中的作用,不能准确反映生物钟基因对胃癌预后的影响[5]。因此,深入探讨生物钟基因与胃癌预后的关系、构建基于生物钟基因的风险评估模型,对筛选高危患者、提高胃癌患者生存率具有重要意义。2019 年6 月—2020 年9 月,本研究利用美国国立生物技术信息中心(NCBI)中GES62254 数据集,分析上述12种主要的生物钟基因对胃癌患者预后的影响,Cox 回归分析筛选出生物钟基因中影响胃癌患者生存的独立预后因素,分析其与临床病理参数的关系,构建了预测胃癌预后的风险评分模型,为实现胃癌的精准评估提供科学依据。
1 资料与方法
1.1 数据资料来源 从NCBI 的GEO 数据库(http://www.ncbi.nlm.gov/geo/)下载GSE62254 数据集。……
