王莽原、宋雷综述，霍强、杨毅宁审校

蛋白质是生理功能的执行者，生命现象的直接体现者。蛋白质组是指研究一个器官、组织或细胞内表达的所有蛋白质。蛋白质组学旨在阐明生物体全部蛋白质的表达模式及功能模式，其内容包括鉴定蛋白质的表达、存在方式（修饰形式）、结构、功能和相互作用，是研究这些蛋白质的组成及变化规律的一个学科。上世纪九十年代起的人类基因组学研究基本完成后，发现很多生物学现象仍无法合理解释，因而出现了蛋白质组学这一新生的前沿学科，由澳大利亚学者Wilkins等[1]于1996年最早提出。

1 国内外蛋白质组研究计划

进入新世纪以来，作为后基因组时代的蛋白质组学研究成为了前沿热点研究领域之一，因此国际人类蛋白质组计划应运而生。其中包括中国科学家贺福初院士领衔的“人类肝脏蛋白质组计划”和美国科学家Gibert Omenn领衔的“人类血浆蛋白质组计划”，“人类肝脏蛋白质组计划”已于2014年6月升级为“中国人类蛋白质组计划”，目前已有胃癌[2]、肝癌[3]、肺腺癌[4]三方面的临床转化的研究成果，将来还要在更多中国常见疾病领域研究蛋白质组临床转化研究，以驱动多种常见疾病的精准治疗，而“人类血浆蛋白质组计划”目前尚未有高质量的临床转化研究成果，因此“人类肝脏蛋白质组计划”大幅度领先于“人类血浆蛋白质组计划”；然而，美国临床蛋白质组肿瘤分析协会（CPTAC）也在乳腺癌[5]、卵巢癌[6]、结直肠癌[7]、肾透明细胞癌[8]、肺腺癌[9]等方面有蛋白质组和基因组筛查结合分析的研究成果，因此，蛋白质组学在中国的发展一直保持着与国际齐头并进的态势，甚至在部分领域引领蛋白质组学的发展。……