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SARS-CoV与SARS-CoV-2结构蛋白辅助T细胞表位的预测及比较

2021-03-18

精准医学杂志 2021年1期
关键词:结构研究

(青岛大学基础医学院病原生物学教研室,山东 青岛 266071)

截至2020年7月12日,新型冠状病毒肺炎(COVID-19)已造成216个国家和地区1 275万人感染,死亡人数达到近57万人[1]。严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)与SARS-CoV和中东呼吸综合征相关冠状病毒(MERS-CoV)同属于尼多病毒目冠状病毒科[2],病毒颗粒的大小为60~220 nm,呈球形或多形性,有包膜,表面有棒状凸起。

世界各国正积极研发新冠病毒疫苗,目前已经有100多种疫苗进入临床前评估,23种候选疫苗正在进行临床评估[3],但是目前对于新型冠状病毒的Th细胞表位的疫苗研究较少。SARS-CoV-2基因组全长30 000 bp[4-5],与SARS-CoV和MERS-CoV的同源性分别为79%和50%[6],SARS-CoV-2的5′端前2/3序列编码RNA复制酶蛋白,后1/3序列编码结构蛋白,该结构蛋白包括刺突蛋白(S蛋白)、包膜蛋白(E蛋白)、膜蛋白(M蛋白)和核衣壳蛋白(N蛋白)。其中S蛋白是Ⅰ型膜糖蛋白,是由两个亚基构成,前端合成S1亚基(氨基酸残基位置16~686),是激发机体产生中和抗体的主要蛋白[7],蛋白氨基酸后1/2部分为S2亚基;E蛋白是冠状病毒中最小的结构蛋白,主要参与病毒包膜的形成以及核衣壳的装配;M蛋白是Ⅲ型糖蛋白,在包膜形成中发挥重要作用;N蛋白是一种磷酸化蛋白,位于病毒粒子的核心部分,主要参与病毒的复制和翻译过程。体液免疫和细胞免疫具有抗SARS-CoV-2感染的作用,其中Th细胞在体液和细胞免疫激发过程中均发挥重要作用。有研究表明,严重急性呼吸综合征(SARS)患者恢复期外周血单个核细胞对结构蛋白的T细胞反应是最强的,同时T细胞应答的强弱与产生中和抗体的多少密切相关[8]。……

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