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DCTPP1基因在乳腺癌中的表达及其生物信息学分析*

2021-03-17贾春丽路鹏霏张瑞丽

重庆医学 2021年4期
关键词:乳腺癌数据库分析

贾春丽,路鹏霏,邱 萍,杨 颖,吴 戈,张瑞丽,毛 睿,张 华

(新疆医科大学第一附属医院肿瘤中心,乌鲁木齐 830000)

乳腺癌是女性常见的恶性肿瘤,全球女性中每年新发乳腺癌患者约有200万,乳腺癌的发病率在逐年增长[1],严重威胁女性健康。而在我国,每年有上万例女性死于乳腺癌[2]。核苷三磷酸焦磷酸水解酶(NTP-PPase)可以水解核苷三磷酸(d)NTP的磷酸二酯键形成核苷单磷酸(d)NMP,释放焦磷酸。NTP-PPase水解异常核苷酸明显减少了细胞核苷酸池中的异常核苷酸,避免了DNA合成过程异常核苷酸的掺入,提高了DNA复制的准确性[3]。DCTPP1基因是NTP-PPase家族中的成员,具有NTP-PPase活性,有研究报道其为抗肿瘤药物研发的潜在靶点[4-5],在DNA复制过程中发挥了重要作用[6]。然而,目前对DCTPPl在临床乳腺癌组织中的表达及功能等相关研究报道较少。本研究旨在利用肿瘤相关数据库,明确DCTPPl在乳腺癌中的表达、分布状态及与乳腺癌患者预后的关系,探讨DCTPP1在乳腺癌发生发展中所发挥的功能,为DCTPP1基因在乳腺癌中的研究奠定基础,现报道如下。

1 资料与方法

1.1 一般资料

TCGA(The Cancer Genome,Atlas http://cancergenome.nih.gov/)数据库包括了肿瘤病例临床基本信息,如基本资料,治疗进程,临床分期,肿瘤病理及生存状况,包括mRNA、microRNA、Copy Number、Mutation、Protein、Methylation信息等。利用ualcan(http://ualcan.path.uab.edu/)对TCGA数据库中包括乳腺癌组织和及正常组织中的多种肿瘤组织及正常组织中DCTPP1基因mRNA的表达水平进行分析。Human Protein Reference Database是一个专门存储人类蛋白质相互作用信息的数据库,在该网站查询DCTPP1基因在乳腺癌组织及正常组织中蛋白的表达状况。

1.2 方法

1.2.1生存分析

利用基因……

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