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Sp1特异性调控先天性心脏病相关基因钙调磷酸酶调节蛋白1基因亚型的转录

2021-03-08李晓勇宋来春

基础医学与临床 2021年2期

李晓勇, 宋来春, 陶 超, 金 晶, 许 铭

(武汉科技大学附属武汉亚洲心脏病医院 心外科 职业危害识别与控制湖北省重点实验室, 湖北 武汉 430022)

先天性心脏病 (congenital heart disease, CHD) 占儿童出生缺陷率的首位,发病率高,危害大,其病因仍然不明[1]。近期研究表明,基因异常在其发病机制中起重要作用。唐氏综合征是最常见的导致CHD的遗传性疾病,其21号染色体上的钙调磷酸酶调节蛋白1基因(regulator of calcineurin 1, RCAN1)被证明是先天性心脏缺陷相关的致病基因[2-3]。RCAN1主要有2个亚型,RCAN1-1主要在中枢神经系统表达,RCAN1-4主要在心肌、胎儿肾脏中表达,这种组织特异性表达的机制不清[4]。因此本课题拟从转录调控入手,研究RCAN1基因不同亚型的启动子区转录因子结合位点的差异,探索其在人体内特异性表达的机制。

1 材料与方法

1.1 材料

RCAN1基因及其上游的序列参照RefSeq (NG-007071.1) 以及UCSC、LOVD、千人基因组计划等数据库。定点突变试剂盒(KOD-Plus-Mutagenesis Kit, TOYOBO公司)。荧光素酶报告基因检测试剂盒 (Dual-Luciferase Reporter Assay System, Promega公司)。荧光定量PCR试剂盒 (GoTaq qPCR Master Mix, Promega公司)。光辉霉素(18378-89-7,Amresco公司)。RNA提取试剂盒(北京天根生化科技有限公司)。

1.2 方法

1.2.1 分子克隆及定点突变: RCAN1-1和RCAN1-4分别通过两个不同的启动子来转录,两个启动子区分别位于第1和第4外显子的上游。在TRANSFAC数据库中通过在线生物信息学软件AliBaba 2.1预测两个启动子区所有可能的转录因子结合位点(http://www.gene-regulation.com),结合既往文献报道及物种属性(只在人体内表达),再对比分析两个启动子区的差别,初步筛选出一个具有差异性的候选转录因子结合位点:Sp1,位于第1外显子上游-129至-138碱基位置,符合Sp1经典结构nyCCGCCsmC。……

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