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中药网络药理学最新进展

2021-03-02袁甜崔琳琳王莹李洋刘莹

中医药学报 2021年1期
关键词:中药数据库机制

袁甜,崔琳琳,王莹,李洋,刘莹

(哈尔滨商业大学药学院 黑龙江省预防与治疗老年病药物研究重点实验室,黑龙江 哈尔滨 150076)

中药经过数千年的发展形成了独特的治疗体系,与多组分协同发挥的治疗特色[1-3]。2007年[4]Andrew L.Hopkins在Nature Biotechnology 上首次明确网络药理学概念,2008 年又于Nature Chemical Biology 进一步撰文,来挖掘中药药效物质基础[5],传统药理学经历了从2002年的系统生物学,2004年网络药理学到多向药理学,2007年网络药理学,最终到2014年的整合药理学。中药网络药理学是时代发展的产物,是中药现代化的必然趋势,网络药理学在中药领域的应用可以大大解决中药现代化遇到的困难,为中药现代化开辟了新天地。

1 网络药理学的概念

网络药理学是通过建立数据库,建立网络,分析网络,实验验证,来阐释疾病的发展过程(如图1)。网络药理学在组学基础上,融合系统生物学,从生物平衡的角度,为探索中药作用机制,开发中药活性成分,提供了有力工具[6-7]。网络药理学[8-9]还通过“药物-靶点-疾病”的网络构造图直观呈现,可以有效打击中药复方的关键节点[10-11],预测中药潜在机制和毒性成分,发现创新性药物。

图1 网络药理学流程图

2 数据的获取和常用数据库

中药数据库中储存了丰富的生物信息、化学信息、药物信息学,分子对接软件为中药的研究与开发提供了契机[12-13]。Gu等[14]通过建立疾病相关的网络,ODE模拟生物网络动态,最后用网络拓扑来分析和预测TCM 数据库内部天然化合物的安全性。Wishart[15]利用DrugBank发现硅药物,DrugBank具有全面靶点信息和详细药物数据包括>4 100种药物,>800种FAD批准的小分子和生物技术药物,以及>14 000蛋白或药物靶标序列,整合了中药药物的结构、药理作用、作用通路等。通过基……

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