基于生物信息学方法的小鼠精子发生关键基因筛选
2021-03-01脱征军邵怀峰张伟新李委奇
中国畜牧杂志 2021年2期
关键词:小鼠
李 欣 ,田 佳,脱征军,邵怀峰,张伟新,李委奇,王 琨,徐 寒,温 万*
(1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京 100193;2.宁夏畜牧工作站,宁夏银川 750105)
转录组是某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA 总和,通过对不同样本的转录组差异研究,不仅可以了解特定时间和空间条件下疾病的发生发展状态,也能作为研究疾病诊断和预后标志物的重要研究手段[1]。目前,RNA-seq 已经成为转录组研究中最为常见的手段,来自不同动物的多个器官的大量RNA-seq数据集陆续出现[1-2],这些数据保存于NCBI 数据库中。精原细胞处于雄性生殖细胞的早期发育阶段,能不断进行有丝分裂,分化为精母细胞。精母细胞经减数分裂成为单倍体的精细胞。单倍体的精细胞经历形态变化、细胞器重排以及代谢途径和方式的改变等,最终形成终末分化的成熟精子,携带着由基因和环境共同决定的遗传信息。研究显示,Sycp3 与精子减数分裂染色体重组过程密切相关[3],Crem 在精母细胞到圆形精子的转换过程起到开关的作用[4]。Zuo 等[5]对小鼠精子变形过程中的圆形精细胞、长形精细胞及附睾尾精子进行了RNAseq 和生物学分析,获得了大量选择性剪接事件、差异表达基因和新转录本信息。虽然对精子发生已有大量研究,但是从精原细胞依次到成熟精子的整体研究很少,且整个过程的分子机制仍不清楚。模式动物小鼠容易饲养,繁殖率高,遗传上有较高的纯合度,代谢类型、生理疾病等与人类接近,也具有完整的精子变形过程,样本取材方便。……
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