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新冠病毒刺突蛋白B细胞线性表位发掘

2021-02-28简春利汪佳琪张露瑶

简春利,汪佳琪,张露瑶,余 瑛,廖 飞

(重庆理工大学 药学与生物工程学院,重庆 400054)

新冠病毒(SARS CoV 2)引发的新冠肺炎疫情对人类生活和经济活动造成巨大冲击。病毒感染涉及病毒从外部入侵人体靶细胞、病毒在胞内复制、子代病毒感染更多细胞、病毒抗原诱发炎症反应等过程。新冠病毒感染患者潜伏期长且潜伏期患者仍有传染性,这迫切需要早期诊断感染的试剂及阻断病毒入侵靶细胞、抑制病毒体内复制、阻滞体内子代病毒感染等环节的药物。针对病毒抗原的高亲和力抗体,是用于新冠病毒感染预防、诊断及阻断感染的关键蛋白药物。所以,对冠状病毒入侵靶细胞所需关键蛋白进行生物信息学分析,发掘适合用于封闭入侵靶细胞必需位点以阻断感染的线性表位,及免疫检测病毒抗原所需特异表位,是研制预防、治疗及检测所需特异抗体的关键。

新冠病毒入侵靶细胞依赖其刺突蛋白(spike protein)与膜受体结合及刺突蛋白敏感位点水解[1];发掘新冠病毒刺突蛋白的重要线性表位,就成为研制所需抗体的关键。病毒蛋白的关键线性表位通常是溶液可及的连续肽段。抗体是蛋白质,识别/结合线性表位时对线性表位周围空间位阻很敏感。蛋白线性表位的空间位阻主要来自蛋白中折叠的肽链,及蛋白翻译后修饰基团。新冠病毒在人细胞内复制,其刺突蛋白在人体细胞内合成;人体细胞内合成的蛋白通常存在糖基化修饰[2]。病毒蛋白抗原的糖基化修饰遮蔽线性表位则抑制宿主体液免疫应答,使病毒逃避宿主免疫系统的识别和攻击[3]。……

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