面向临床研究的医院真实世界数据治理与建议
2021-02-18吴燕秋WUYanqiu梁公文LIANGGongwen王天兵WANGTianbing
□ 吴燕秋 WU Yan-qiu 梁公文 LIANG Gong-wen 王天兵 WANG Tian-bing
我院信息化系统起步于1995 年,在随后的20 多年中,逐步完成了电子病历系统、移动护理系统、病理系统、手术麻醉系统、检验检查系统、超声系统、心电图系统、输血系统、重症监护系统等各类临床业务信息系统建设,也积累了大量的医疗诊疗、临床检验检查结果、临床用药等全流程、患者全生命周期的数据,具有非常高的临床研究价值[1]。
然而,由于历史原因,医院数据存在着诸多问题:临床诊疗数据存储不集中,分散在医院各个信息系统;各信息系统的数据结构不一致,格式繁杂,包括结构化、半结构化、文本数据、影像数据等不同格式,甚至医生手写的书面数据等;数据非结构化、非标准化,难以形成临床研究所需的变量;数据质量参差不齐、完整性差;数据未脱敏,患者隐私、数据安全无法保障;数据确权问题尚未明晰等。
本文以临床研究为导向和需求,从尽可能使医院数据应用于高水平研究的角度,阐述了我院面向临床研究的真实世界数据治理实践过程和经验,提出相关思考和建议。
我院面向临床研究的真实世界数据治理实践
我院自2019 年起开始面向临床研究的医院真实世界数据治理实践,见图1。主要过程如下:(1)面向分析与查询的临床研究通用数据模型(Common Data Model,CDM)的设计。基于医疗行业和真实诊疗数据的特点,遵循医院数据治理的通用规律和思路,我院建立了符合我院业务实际的CDM。CDM 中包含300 余项结构化字段(性别、年龄、身高、体重、诊断名称、诊断日期、检验项目名称、药品名称、药品规格等)和80 余项非结构化文本字段(入院记录、病程记录、各类检查报告、出院记录、死亡记录、术前小结等各类文书内容)。……
