董 博 王志林 魏文康,3 井晓欢 刘 石 鄢秋龙 蒋宗勇 刘文华 胡译尹 陈 庄*

(1.广东省农业科学院农业生物基因研究中心，广东省农作物种质资源保存与利用重点实验室，广州510640；2.广东省畜禽疫病防治研究重点实验室，农业农村部兽用药物与诊断技术广东科学观测实验站，广州510640；3.岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心，茂名525000；4.深圳国家基因库，深圳510083；5.大连医科大学微生物教研室，大连116044；6.广东省农业科学院，广州510640)

肠道是营养物质消化吸收、微生物与宿主互作的主要部位。肠道微生物作为肠道生态系统的重要部分和调节因子，其健康状态关系着断奶仔猪的正常生长和发育[1]。仔猪断奶应激一直是困扰养猪业的难题，断奶前后仔猪胃肠道微生物区系也发生剧烈的变化。断奶前后仔猪胃肠道微生物区系的基因组学研究和功能活性的研究已有报道[2-16]。Li等[2]研究了断奶前后仔猪结肠内容物的微生物基因组，发现分别含有1 584和1 157个操作分类单元(operational taxonomic unit，OTU)，其中分别有137和85个特定OTU。尽管如此，目前人和动物肠道微生物组研究中，仍然有超过一半宏基因组测序不能得到明确的菌种信息，更不能获得分离纯化的单菌株，以进行表型、功能以及与宿主的互作研究[17-22]，因此需要对传统的菌株筛选方法进行优化改造。培养组学(culturomics)是一种使用多种培养条件和16S rRNA测序相结合，对样品中的微生物进行系统地筛选分离培养的方法[17,23-32]。培养组学方法可以将之前认为不可培养的菌株培养起来，较大程度地发现潜在的新菌株，丰富现有的可培养肠道菌株资源库，为开发缓解断奶应激的益生菌打下基础。……