基于线粒体COI基因5′端区段粉螨DNA条形码研究
2021-01-29张兰香詹雨娟李梦珠李心玫褚凌渺孙恩涛
张兰香,詹雨娟,李梦珠,王 严,李心玫,褚凌渺,孙恩涛
(皖南医学院 卫生检验与检疫学教研室,安徽 芜湖 241002)
粉螨隶属于蜱螨亚纲(Acari)、真螨总目(Acariformes)、无气门亚目(Astigmata)。粉螨种类繁多,是重要的致敏原,可导致螨性过敏性疾病[1]。不同粉螨所含致敏原不同,因此,粉螨的准确鉴定可为临床药物和免疫治疗提供基础资料[2]。螨类鉴定主要依据成螨形态,然而粉螨个体微小、生境复杂等现象难以实现快速准确的形态学鉴定[3]。
自2003年Hebert等[4]提出DNA条形码概念,DNA条形码广泛应用于物种鉴定[5-6]。目前,常用于螨类鉴定的分子标记主要包括线粒体基因和核基因[5-7]。线粒体COI基因具有较快的进化速率、明显的种间差异、较低的种内变异等特性,因而常用于探讨近缘种、地理种群等低级阶元的鉴定[7-9]。Webster等[8]基于377 bpCOI基因中央区段鉴定粗脚粉螨(Acarussiro)及其近缘种小粗脚粉螨(A.farris)和静粉螨(A.immobilis);吴太葆[9]基于该中央区段研究不同地理种群的椭圆食粉螨(Aleuroglyphusovatus)和腐食酪螨(T.putrescentiae),未发现不同地理种群间该中央区段序列存在差异。
研究表明,COI基因不同区段的进化速率差异会影响DNA条形码的鉴定[6,10]。Yang等[11]应用377bpCOI基因中央区段对粉螨进行物种鉴定,未扩增到热带无爪螨(Blomiatropicalis)的目的片段,且不同螨种所需退火温度差异较大;Khaing等[12]基于该中央区段的系统树表明建树结果不符合形态学分类,且部分粉螨的分类置信度较低。因此,仅基于377bpCOI基因中央区段对粉螨进行分类鉴定有一定局限性。
线粒体DNA的661 bpCOI基因5′端区段[13]被广泛用于痒螨、蠕形螨等螨类的物种鉴定[5-6]。……
