蓝青萍，冯凯，王晓丹，潘玥，陈俊英，孙强明

中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室，云南昆明650118

西尼罗河病毒（West Nile virus，WNV）是一种单链正义RNA 病毒，属于黄病毒科黄病毒属，于1937年首次从西尼罗河乌干达省一名发热妇女的血液中分离出来，在随后的几十年里，WNV 席卷了亚洲、欧洲、非洲、北美等地区［1-3］。

WNV 是病毒性脑炎的主要病原体，在自然界中，以鸟-蚊-鸟的传播周期维持循环，主要通过蚊虫尤其是库蚊媒介进行传播［4-5］。人类感染WNV 可引起西尼罗热和WNV 性脑炎，临床症状包括无症状感染或轻度急性发热性疾病及神经系统疾病，包括脑膜炎、脑炎、急性弛缓性麻痹［6-7］。WNV 具有生物多样性，基于遗传差异，目前提出了9 个WNV谱系［3，8］，见表 1。由于目前对 WNV 感染尚无明确的治疗方法，因此开发安全有效的人用疫苗对预防WNV 感染至关重要［9-10］。不同地理位置的WNV 遗传变异可能与病毒的毒力、扩增和遗传等有关，研究发现，WNV 的 E 蛋白第 154 ～ 156 位点是糖基化位点，被认为是毒力因子，该位点的删除可降低病毒的复制［11］，因此推测该位点可作为WNV 疫苗研究的潜在靶点。

本研究分析了亚洲区来自中国、马来西亚、印度、以色列、巴基斯坦、伊朗和土耳其等WNV 流行株的进化特征、流行趋势及WNV 结构蛋白E 的核苷酸和氨基酸突变特征等，旨在为后续研究WNV的传播和感染机制及疫苗的研发提供依据。

表1 WNV 谱系概述Tab.1 Overview of WNV lineages

1 材料与方法

1.1 亚洲区WNV 流行株核酸序列获取 以“West Nile virus”为检索词在 NCBI-Pubmed 查询……