宜昌地区杂交籼稻品种DNA指纹图谱构建
2020-09-09张弩申露露杜芹汪倩芳申艮宝王惠
张弩 申露露 杜芹 汪倩芳 申艮宝 王惠



摘要 通过SSR引物多态性分析,构建了宜昌地区49份杂交籼稻品种的DNA指纹图谱。35对SSR引物共检测到61个多态性位点,其中最少的为2个,最多的为6个,平均每对引物可以检测到2.5个位点。利用10对核心引物,构建了不同杂交籼稻品种DNA指纹图谱,为宜昌地区水稻品种保护和种子鉴定提供了基础。
关键词 水稻;SSR;DNA;指纹图谱
中图分类号 S 511.2+1文献标识码 A文章编号 0517-6611(2020)16-0109-03
doi:10.3969/j.issn.0517-6611.2020.16.029
Construction of DNA Fingerprint of indica Hybrid Rice Varieties in Yichang Area
ZHANG Nu, SHEN Lu-lu, DU Qin et al
(Yichang Seed Supervision Station, Yichang, Hubei 443005)
Abstract To establish DNA fingerprint of indica hybrid rice varieties in Yichang area, 49 tested varieties were studied using SSR markers. The results showed that 35 pimers detected 61 alleles in total among 49 varieties, with 2-6 alleles (2.5 alleles an average) amplified by each primer. According to the analysis of 10 pairs of core SSR markers, we constructed DNA fingerprint database for 49 indica hybrid rice varieties, which would be helpful for the application of SSR markers in rice variety and purity identification in Yichang area.
Key words Rice;SSR;DNA;Fingerprint map
作者簡介 张弩(1966—),男,湖北枝江人,正高职高级农艺师,硕士,从事农作物种子监管、质量检测及推广工作。
收稿日期 2020-03-01
水稻是世界主要粮食作物之一。杂交水稻的研究和推广为我国粮食安全提供了重要保障。水稻种子产业快速发展是杂交水稻大面积推广的前提条件,而现今不同程度的水稻品种雷同、侵权等现象已经制约了水稻种子产业的发展,构建水稻品种种子身份证是解决这一问题的有效途径。
分子标记是以DNA多态性为基础的遗传标记,具有准确性高、信息量大、稳定性好等优点;利用分子标记构建DNA指纹图谱已成为农作物品种真伪性鉴定的发展趋势和重要手段。SSR(simple sequence repeat)标记是一种共显性分子标记,具有操作简单、多态性丰富、稳定性好等优点[1-2],在农作物DNA指纹图谱构建、遗传多样性分析、基因克隆等方面得到了广泛的应用[3-7]。利用SSR标记构建DNA指纹图谱在杂交水稻研究方面已有不少报道。蔡海亚等[8]报道了湖北省两系不育系指纹图谱构建;陆徐忠等[9]通过建立SSR指纹图谱,构建了杂交水稻亲本身份证;徐港明等[10]对太湖地区24份杂交粳稻进行了指纹图谱构建及遗传相似性分析。……
