基于TP0136蛋白异质性建立一种新的苍白密螺旋体分子分型方法
2020-08-18魏然柯吴坚陈文韬谭玲俏刘雅慧吕萍黄涛张君张晓辉王柳苑车雅敏
魏然 柯吴坚 陈文韬 谭玲俏 刘雅慧 吕萍 黄涛张君 张晓辉 王柳苑 车雅敏
1天津医科大学总医院皮肤性病科300052;2南方医科大学皮肤病医院皮肤二科,广州510091;3阳江市公共卫生医院皮肤性病科,广东529500;4清远市慢性病防治医院皮肤性病科,广东511500
密螺旋体属(Treponema pallidum,TP)包括雅司苍白密螺旋体(Treponema pallidum ssp.Pertenue,TPE)、未分类的类人猿密螺旋体(Fribourg-Blanc,FB)、地 方 密 螺 旋 体(Treponema pallidum ssp.endemicum,TEN)、梅毒苍白密螺旋体(Treponema pallidum ssp. Pallidum,TPA)等。雅司病的病原体TPE、地方性梅毒的病原体TEN 与FB 的基因组具有高度亲缘性,且雅司病的临床症状与血清学检测特征难以和梅毒区分[1-2]。因此寻找一种合适的TP分型方法,对TP 的分子流行病学研究和临床防治十分关键。
既往研究显示,TPA基因亚型与毒力、耐药性、病期的发展转归等具有密切关系[3]。现有的TPA酸性重复蛋白(acidic repeat protein,Arp)/重复基因(T.pallidum repeat gene,Tpr)双基因分型方法[4]和Arp/Tpr/TP0548 三基因联合分型法[3]具有结果稳定、重复性好的特点,适用于多种来源的临床样本,目前被普遍采用。然而,我国高达88%的TPA株为14D/f 亚型,无法得到进一步区分,因此现有的双/三基因分型方法均不适用于我国梅毒流行株的研究[1,3,5]。近年来研究者对多个可变位点进行分析,试图选取TP0279、TP0558 、TP0326 等新的基因位点用于临床鉴别,但分型效率均不理想[5-6]。我们前期研究发现,在TP 不同菌种和TPA 不同菌株中TP0136存在基因异质性[7]。利用这一特点,我们通过研究TP0136蛋白在TPA、TPE、FB和TEN 各种之间的异质性,建立一种新的TP分子分型方法。
材料与方法
1.主要试剂与仪器:梅毒螺旋体明胶凝集试验(TPPA)试剂盒(日本富士瑞必欧株式会社),甲苯胺红不加热血清试验(TRUST)试剂盒(上海荣盛生物技术有限公司),QIAamp DNA Mini 试剂盒(德国Qiagen公司),T100PCR仪(美国Bio-Rad公司)。……
