PRMT1影响胃癌PI3K-AKT通路基因表达的转录组分析
2020-07-13刘蒙蒙楼文晖孙剑勇吴伟新
安徽医科大学学报 2020年6期
刘蒙蒙,姜 浩,楼文晖,宋 超,孙剑勇,吴伟新
近年来胃癌发病率逐年升高,虽然通过手术及化疗,患者生存期显著延长,但总体死亡率仍居高不下[1]。蛋白精氨酸甲基转移酶(protein arginine methyltransferase, PRMT1)在体内广泛存在,发挥着重要作用,多年来的研究[2]表明PRMT1广泛参与了细胞内信号转导、转录调节、DNA损伤修复以及mRNA剪接等多种细胞生理活动过程。因此,对PRMT1的研究有助于进一步了解细胞生长与增殖调控和肿瘤的发生发展,有望寻求肿瘤药物治疗的新靶点。转录组是连接生物功能与基因组遗传信息的桥梁,在探索疾病的发生发展及基因调控等方面发挥了重要作用。现通过高通量测序对胃癌组织标本与癌旁组织的差异表达谱进行京都基因与基因组百科全书富集分析(kyoto encyclopedia ofgenes and genomes, KEGG),探讨胃癌中PRMT1影响代谢通路的基因表达情况,从转录组学和代谢组学层面为胃癌诊治寻找新线索。
1 材料与方法
1.1 组织样本及主要试剂
1.1.1病例资料 选取复旦大学附属中山医院青浦分院2018年9月胃癌患者术后新鲜胃癌组织标本2例及相应癌旁正常组织标本2例,正常对照来自手术边界5 cm以上,均经病理学诊断证实。其中男1例,60岁;女1例,72岁。其病理均为胃中-低分化腺癌。患者术前无放化疗及靶向等肿瘤相关治疗,无高血压、糖尿病等合并症。并选取2018年1~9月间在复旦大学附属中山医院青浦分院普外科行胃癌根治手术患者的组织蜡块。共入组25例,其中男15例,女10例,年龄64~82(64±9.385)岁。纳入标准:①均经病理学诊断明确为胃腺癌;……
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