新诊断胶质瘤MGMT基因启动子甲基化水平定量分析
2020-07-10张国臣常玉喜陈忠平
张国臣 常玉喜 韩 磊 徐 欣 赵 明 陈忠平
O6-甲基鸟嘌呤-DNA 甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT)可以修复烷化剂对染色体的致癌、致突变和细胞毒作用的损伤。在正常情况下,MGMT对细胞起保护作用,但是在胶质瘤的化疗过程中,MGMT 可以修复化疗药物对胶质瘤细胞产生的杀伤,从而降低化疗疗效[1]。MGMT 基因启动子甲基化(简称MGMT 甲基化)可以降低MGMT的表达。本文定量分析新诊断胶质瘤MGMT甲基化水平,为临床诊治提供参考。
1 资料和方法
1.1 标本来源 收集郑州大学附属肿瘤医院神经外科2016年1月至2019年6月手术切除并经病理诊断为胶质瘤标本225例,其中男116例,女109例;平均年龄(48.71±14.82)岁;少突胶质细胞瘤50 例(WHO分级Ⅱ级36 例,Ⅲ级14 例),星形细胞瘤109 例(WHO分级Ⅰ级4例,Ⅱ级58例,Ⅲ级47例),少突星形细胞瘤9 例(WHO 分级Ⅱ级),胶质母细胞瘤(WHO分级Ⅳ级)57例。
1.2 入组标准 经手术病理证实为胶质瘤;新诊断初治胶质瘤;肿瘤组织行MGMT甲基化水平检测。
1.3 排除标准 术后病理证实为非胶质瘤;既往经过放、化疗等治疗的复发胶质瘤;肿瘤组织未行MGMT甲基化水平检测。
1.4 MGMT 的检测 采用焦磷酸测序仪(美国QIAGEN 公司,Qiagen PyroMark Q24),严格按照Human MGMT Gene methylation Detection Kit 试剂盒(美国QIAGEN公司)说明书进行测序。采用TIANamp FFPE DNA Kit 提取DNA,DNA 浓度为20 ng/μl,OD 260/280 为1.82,检测灵敏度为1%(10 ng/μl DNA),引物类型为YGAYGTTYGTAGGTTTTYGT。标本类型为石蜡块。结果判读:选择MGMT 基因启动子区甲基化水平最高的4 个CpG 位点,将各位点的甲基化水平以百分率的形式作为定量数据,取4 个位点的平均值作为最终MGMT甲基化水平。
1.5 判断标准 健康人群血液平均检测值:MGMT 甲基化水平≤4%。胶质瘤平均检测值:MGMT 甲基化水平≥8%为阳性,否则判为阴性,其中MGMT甲基化水平≥40%病人,替莫唑胺化疗总生存期明显延长[2]。……
