陶 然，赵卫红，秦博宇，焦顺昌

解放军总医院第一医学中心 肿瘤内科，北京 100853

乳腺癌是世界范围内女性最常见的恶性肿瘤，严重威胁女性生命健康。近年来与西方发达国家比较，我国女性乳腺癌发病率和死亡率快速上升，且呈现出年轻化趋势[1]。与中老年女性乳腺癌相比，年轻乳腺癌患者(≤35岁)就诊时病理学分期更晚、组织学分级更高、侵袭性更强，同时也更容易出现多器官转移及骨髓侵犯[2-4]。由于该年龄段患者数量的限制，目前针对年轻女性乳腺癌相关基因的分子生物学功能及通路分析国内外鲜有报道。本研究通过生物信息学方法处理医学癌症数据库(The Cancer Genome Atlas，TCGA)中年轻女性乳腺癌相关转录组数据，筛选出差异表达基因的同时构建蛋白质相互作用网络，并着重对网络中表达上调的核心基因进行分析。初步探索年轻女性乳腺癌在分子水平的发生发展机制。

资料与方法

1 资料 通过TCGA数据库(https：//gdc-portal.nci.nig.gov)下载女性乳腺癌相关转录组数据集(RNA-seq v2 level3)，检测平台均为Illumina HiSeq 2000 RNA Sequencing。在保留筛选条件为年龄≤35岁的样本数据后共得到了32例样本，其中包括29例肿瘤组织样本和3例正常乳腺组织样本。

2 差异表达基因筛选 采用R3.4.1中的Limma程序包(Version 3.32.5)对TCGA数据库中年轻女性乳腺癌转录组数据集归一化处理并与正常乳腺组织的基因表达值进行比对筛选差异表达基因(differentially expressed genes，DEGs)。对筛选出的差异表达基因采用R3.4.1中的Pheatmap Version 1.0.8包绘制火山图以及双向层次聚类热图。差异表达基因筛选条件为|log2FC|＞0.5同时FDR＜0.05。

3 蛋白质相互作用网……