吕珊妹 徐文杰 王艺臻 董学君

乳腺癌是全球女性癌症死亡的主要原因[1, 2]。尽管手术结合放化疗的诊疗手段取得了一定的提高，但其预后不良的情况并未改善[3,4]。因此，从分子水平深入研究乳腺癌潜在的发生、发展机制，对延长乳腺癌患者的生存时间具有重要意义。细胞有丝分裂相关基因ASPM (abnormal spindle microtubule assembly)位于1号染色体，编码3477个氨基酸残基组成的蛋白质，在正常细胞有丝分裂过程中发挥纺锤体功能是必不可少的[5, 6]。近年来研究发现，ASPM在多种癌症中异常表达，且与肝癌、卵巢癌、胰腺癌和前列腺癌等多种肿瘤的不良预后显著相关[6～9]。然而，ASPM参与癌症进展的机制尚不明确，并且其在乳腺癌中的表达和作用机制的研究较少。为深入研究ASPM与乳腺癌的相关性，本研究使用Oncomine在线数据库分析ASPM在乳腺癌中的表达水平，并利用GEO (gene expression omnibus)和TCGA (the cancer genome atlas)公共数据库中的乳腺癌基因芯片数据，探讨ASPM与乳腺癌患者临床病理指标的相关性及其对预后的影响。通过基因富集分析 (gene sets enrichment analysis, GSEA)、String以及TIMER数据库进一步预测ASPM在乳腺癌发生、发展中可能参与的信号通路及作用机制。同时RT-qPCR验证ASPM在乳腺癌临床组织样本中的表达情况。

材料与方法

1.ASPM表达量分析:利用Oncomine数据库 (https://www.oncomine.org/resource/login.html) 分析ASPM在乳腺癌组织中的表达情况。以正常组织为对照，选择差异表达倍数大于2倍、基因排位于前10%且P=0.000的结果，选择箱式图展现结果。本研究设置的筛选条件：①Gene：ASPM；②Analysis Type：cancer vs normal analysis；③Cancer Type：breast cancer；④Data Type：mRNA；⑤Sample Type：Clinical Specimen。

2.ASPM与乳腺癌患者临床资料相关性分析:在美国国立生物技术信息中心 (National Center for Biotechnology Information, NCBI)上的GEO公共数据库 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中下载乳腺癌基因表达谱数据集GSE3494的系列矩阵数据文件，以获得表达原始数据和临床资料。……