骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者常见基因突变的差异
2020-05-21廖林晓王树娟刘延方常银银王伟琼陈胜梅姜中兴
廖林晓,王树娟,王 冲,刘延方,常银银,王伟琼,马 杰,李 涛,陈胜梅,姜中兴
1)郑州大学第一附属医院血液科 郑州450052 2)上海源奇生物医药科技有限公司 上海201400
急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)和骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes,MDS)是髓系恶性疾病,目前认为其多数患者存在基因突变;随着二代测序技术的临床应用,AML和MDS的基因突变日益受到重视[1-2]。临床上观察到MDS可以进展为AML,而其驱动基因仍不清楚。比较MDS和AML患者基因突变谱的异同,有助于理解髓系恶性疾病演化过程的内在分子机制。本研究通过二代测序技术比较分析AML和MDS的22种常见基因突变率的差异,为更好揭示AML和MDS发生的分子机制提供初步依据。
1 对象与方法
1.1研究对象本研究共纳入2017年6月至2019年1月郑州大学第一附属医院血液科诊治的749例AML和218例MDS患者。 AML患者的中位年龄为48(14~86)岁,男400例,女349例;检测时疾病状态为初诊703例,复发14例,MDS转化的AML 32例;MDS患者的中位年龄为54(17~86)岁,其中男122例,女96例。所有患者均依据2016版WHO血液肿瘤分类标准[3]进行诊断分型,并应用二代测序技术对其骨髓标本进行基因突变检测(伦理审查编号:2019-KY-194)。
1.2基因突变的检测使用肝素锂采血管收集AML或者MDS患者治疗前的骨髓液2 mL,提取单个核细胞,应用常规方法提取DNA,取1 μg DNA制备DNA全基因组文库。采用AML/MDS二代测序基因芯片(上海源奇生物医药科技有限公司),PCR扩增目的基因(AML/MDS 相关22个突变基因),将目标区域DNA富集后,采用Illumina测序平台进行测序。测序后的原始数据利用NCBI、CCDS、dbSNP(v138)、COSMIC、人基因组数据库(HG19)等数据库进行生物信息学分析,确定致病性突变位点,平均测序深度为4 837.978 kb。……
