吴杰，全建平，叶勇，吴珍芳，杨杰，杨明，郑恩琴

综 述

染色质转座酶可及性测序研究进展

吴杰1，全建平1，叶勇1，吴珍芳1，杨杰1，杨明2，郑恩琴1

1. 华南农业大学动物科学学院，国家生猪种业工程技术研究中心，广州 510642 2. 仲恺农业工程学院，动物科技学院，广州 510225

染色质转座酶可及性测序(assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing, ATAC-seq)诞生于2013年，具有比脱氧核糖核酸酶I超敏感位点测序(deoxyribonuclease I hypersensitive site sequencing, DNase-seq)和微球菌核酸酶敏感位点测序(micrococcal nuclease sequencing, MNase-seq)更快速、灵敏、简便的优点，是目前分析全基因组范围染色质开放区域的热点技术。通过该技术能获得染色质开放区域的相关信息，从而映射出转录因子等调控蛋白的结合区域和核小体定位等信息，对于研究表观遗传分子机制具有重要意义。本文比较了5种获取染色质开放区域技术的优缺点，重点介绍了ATAC-seq的原理和主要流程，描述了利用ATAC-seq技术研究染色质开放区域的发展概况以及ATAC-seq的相关应用，期望对真核生物全基因组水平的染色质开放区域研究、顺式调控元件鉴定以及遗传调控网络的解析等提供借鉴。

染色质转座酶可及性测序；染色质开放区域；Tn5转座酶；表观遗传修饰；转录因子

自然界中的生物根据其细胞核类型可以分为原核生物和真核生物，其中原核生物的细胞核无核膜包被，其遗传物质DNA裸露在外；而真核生物细胞的细胞核DNA并非裸露，而是以左旋超螺旋的方式(约147 bp)绕八聚体结构的组蛋白1.67圈，进而形成核小体[1,2]。相邻核小体的连接区由10~80 bp的游离DNA与组蛋白H1共同构成；核小体通过连接区的连接形成串珠式结构，这种串联结构进一步折叠、凝聚，形成染色质；……