APP下载

2017-2018年陕西省H7N9禽流感病毒流行特征及基因进化分析

2020-04-13张俊君焦亚东张少白余鹏博

中国人兽共患病学报 2020年2期

史 伟,李 慎,吴 瑞,张俊君,李 俊,高 涛,焦亚东,张 蕾,徐 艺,张少白,余鹏博

2013年长三角地区的上海市和安徽省先后报告H7N9流感病毒引起的人间感染病例,这也是全球首次报道的人类感染该亚型的流感病毒[1]。截至2017年4月,全球共报告1 344例人感染H7N9流感确诊病例,其中死亡511人[2]。迄今为止,陕西省共报告7例人感染H7N9流感病例和2起禽间H7N9疫情。其中2017年5月,咸阳市一例重症肺炎病例在西安被确诊为H7N9病例,为陕西省首例H7N9流感病毒导致的人类感染病例[3],此后又发现6例人感染病例[4]。

为评估H7N9流感病毒暴露风险,为防控工作提供科学依据,本研究对2017年5月至2018年3月陕西省H7N9流行分布和基因特性进行整理和分析。

1 材料与方法

1.1样本采集 陕西省在每个地市均设有监测点,长年开展外环境禽流感病原学监测任务[5]。采样方法参考《职业暴露人群血清学和环境高致病性禽流感监测方案(2011版)》[6]的要求,采集禽类粪便、禽类饮水、禽笼具表面擦拭等类型环境标本。

H7N9报告病例检测及禽间疫情暴露环境监测:按照人感染H7N9禽流感疫情防控方案(第3版)》[7]和《人感染H7N9禽流感病毒标本采集及实验室检测策略》[8]进行样本采集和流行病学调查。

1.2病毒检测与毒株分离 待检样本暂存于4 ℃并于24 h内送至当地流感网络实验室。核酸提取采用凯杰公司QIAamp Viral RNA Mini Kit (Cat No.52904)提取。所有样本先开展甲型流感初筛,阳性样本再进行H7亚型检测。流感分型试剂由江苏硕世生产。国家流感中心对阳性样本进行复核和鸡胚毒株分离,并对毒株利用Illumina平台进行全基因组测序;……

登录APP查看全文