谷子NCED基因家族鉴定及其干旱胁迫响应表达模式分析
2019-08-13程鸿燕郭昱马芳芳
程鸿燕 郭昱 马芳芳


摘要:基于转录组数据分析并结合谷子基因组数据库鉴定出10个候选NCED基因,对它们的结构特点、理化性质、启动子元件功能等进行分析,并以抗旱(GG)和干旱敏感谷子品种(JF16)为材料,对PEG胁迫前后差异基因的表达特点进行分析。结果表明,谷子中编码NCED家族基因启动子中含较多与抗旱胁迫相关的功能元件;经PEG胁迫处理后,Seita.2G035400在GG和JF16中表达量均上调,但上调幅度有所差异。该研究结果进一步加强了对植物NCED基因家族的了解,也为后续进行谷子抗旱机制和抗旱分子育种提供了理论借鉴依据。
关键词:谷子;NCED家族基因;干旱胁迫;表达;生物信息学
中图分类号: S515.01 文献标志码: A 文章编号:1002-1302(2019)01-0040-04
谷子[Setaria italica (L.) P. Beauv.]是禾本科狗尾草属的粮草兼用作物,最早被驯化种植于中国北方,已有8 700多年的栽培史[1],其营养价值高,富含人体所需的类胡萝卜素、氨基酸、叶酸和硒等成分[2],至今仍被誉为“五谷之首”。谷子叶面积小、自花授粉、蒸腾效率和水分利用效率高,具有耐干旱、耐贫瘠特性[3]。但是近年来,随着全球气候变暖,可利用水资源日趋匮乏,干旱成为制约作物正常生长发育的关键因素之一。
发掘谷子耐旱基因,了解其基因家族在干旱胁迫条件下的表达模式,对谷子抗旱新品种选育具有极为重要的指导作用。作物在干旱、盐碱、低温、冻害等非生物胁迫条件下,可通过自身调节来适应或抵制这些胁迫[4-5]。脱落酸(abscisic acid,ABA)作为一种植物激素,是一种极为重要的逆境信号,不仅在植物生长发育过程不同阶段起重要作用,而且在干旱、低温、衰老、盐渍等多种逆境响应中起着重要调控作用,可通过介导叶片气孔关闭过程来抵御干旱胁迫[6-7]。……
