利用高分辨率熔解曲线技术进行猪亲子鉴定的研究
2018-12-21陈焱森沈永巧张淑君
陈焱森,谢 苏,沈永巧,张淑君,黄 涛
(1.石河子大学动物科技学院,新疆石河子 832000;2. 华中农业大学动物科技学院,动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,湖北武汉 430070;3. 乌苏市畜牧兽医站,新疆乌苏 833300)
亲子鉴 定(Identification in Disputed Paternity)是指确定是否为父亲与子女的亲生关系[1]。目前国内外已经开展了动物的亲子鉴定工作,如马匹[2]、奶牛[3]、肉牛[4]、东北虎[5]、绵羊[6]、豚鹿[7]等动物亲子关系的确认都已成功解决,但在猪上的高效亲子鉴定方法还需进一步研究,并且在猪的育种中,亲子鉴定是一种防止人工出错的有效手段。
传统的亲子鉴定方法有标准抗血清法、多价抗血清法与蛋白电泳区分法等方法,但准确率均较低[2]。随着微卫星研究的深入,其在亲子鉴定中的应用逐渐增多。微卫星是DNA重复序列[8],故又称简单重复序列(Simple Sequence Repeats,SSR)。 1998年,Jeffreys等[9]对SSR做了进一步探究,并使之成为新一代分子遗传标记。对SSR产物的传统检测方法是在PCR反应结束后,对扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳[10],后发展为可以通过毛细管电泳的方法在自动分析仪上完成,提高了工作效率,但在电泳前仍需对PCR产物处理(如脱盐)。SSR的扩增产物也可以在自动测序仪上进行电泳分析,但要求PCR所用引物分别进行荧光标记,使成本增加。所以,寻求操作简单、高效的SSR标记检测方法具有重要意义。
2003年,美国Utah大学的Wittwer实验室首次提出了基于新型饱和荧光染料LCGreen而发明基因突变检测的高分辨率熔解曲线新技术(High-Resolution Melting Curve Analysis,HRM)[11]。HRM主要是根据DNA序列长度、GC含量以及碱基互补性差异,通过PCR之后的熔解曲线分析检测PCR片段的微小序列差异,其分辨精度可以达到对单个碱基差异的区分[12-13]。……
