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诺如病毒是引起人类非细菌急性胃肠炎的首要病原体[1]。全世界范围内约1/5的腹泻病例与诺如病毒感染相关，每年约导致20万人死亡[2]。诺如病毒进化变异速度快，每隔2～3年会出现新的流行株引发大流行，其机制[3]主要是：①诺如病毒衣壳蛋白区氨基酸发生突变，其中P区处于高度变异，被认为是免疫识别和与人体组织血型抗原(HBGA)结合的关键部位[4]；②基因重组。在过去二十年间诺如病毒GII.4型一直为优势流行株[5]，直至2014-2015冬季在多个亚洲地区国家新型GII.P17-GII.17型基因型取代GII.4_Sydney_2012型成为优势流行株[6]；但中国CDC报道自2016下半年以来新重组基因型GII.P16-GII.2在诺如病毒暴发病例中检出率超过GII.P17-GII.17及GII.4型，成为我国引起急性胃肠炎暴发的优势基因型[7]。本文收集舟山海岛地区2017年5-11月4起学校发生的急性胃肠炎暴发疫情病例样本，通过扩增其聚合酶-衣壳区(B-C区)，近乎完整的聚合酶区(RdRp)及衣壳蛋白区(VP1)基因序列，鉴定引起本轮诺如病毒暴发疫情的基因型别及分子特征，为诺如病毒的防控提供科学的依据。

1 材料与方法

1.1样本来源及处理 2017年5-11月，舟山市定海区两所幼儿园、一所小学及普陀区一所小学共发生4起急性胃肠炎暴发事件，疫情所在的县区疾控共送检40例样本，其中肛拭子21份、呕吐物13份、粪便6份；对固体样本取豌豆大小 (液体取100 μL) 加到1.5 mL EP管中，加入900 μL的pH 7.2的PBS (10 mmol/L) 缓冲液，振荡1 min。然后静置5 min，再以10 000 r / min离心3 min，然后吸取200 μL上清液，使用QIAGEN Reansy Mini Kit试剂盒按照说明书提取病毒核酸。

1.2诺如病毒筛查 使用TAKARA公司One Step PrimeScriptTMRT-PCR Kit试剂盒用于GI型和GII型诺如病毒筛查。……