大熊猫轮状病毒CH-1株研究进展
2018-12-13,,
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轮状病毒(Rotavirus,RV)是引起儿童发生严重腹泻甚至死亡的重要病原[1],它还能够感染牛、猪、马、羊、兔、禽、猫类等动物并引起病毒性腹泻。在我国,王成东等于2009年首次从大熊猫腹泻粪便中检测出轮状病毒,将其命名为大熊猫轮状病毒(Giant Panda Rotavirus,GPRV)CH-1毒株。迄今为止,在人类、哺乳动物和鸟类分离的RV根据病毒外壳特异性抗原可将RV分为A~I 9个不同的组,其中A、B、C和H组可感染人和动物,而D、E、F、G和I组只感染动物[2-4]。RV包括P和G两种血清型,其中G1-G4、G9、P[8]和P[4]是最常见的流行优势株,在全球主要流行的RV基因型G1P[8],G2P[4],G3P[8]和G12P[8][5]。GPRV CH-1株的血清型为G1-P[7]-I5- R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1[6]。
GPRV CH-1株主要感染5-11月龄的断奶大熊猫,感染后通常表现为体温升高、呕吐、水泻、蛋花样腹泻,腹泻物中含有血,白细胞总数和中性粒细胞增多,淋巴细胞减少、腹水、顽固性胃肠胀气、腹泻迁延不愈甚至死亡等症状[7-8],通过常规对症治疗能较大缩短该病的治疗疗程、治愈率达100 %,且很少出现并发症[8],但目前尚无有效疫苗和特效药物对GPRV感染进行防治,这对大熊猫的健康造成了严重威胁。
1 GPRV基因结构及进化特点
GPRV CH-1株属于呼肠孤病毒科轮状病毒属,病毒粒子呈球形似车轮状,直径70 nm[7]。GPRV CH-1株基因组为线状双股RNA,它包含11个基因片段(1-11),这些基因分别编码6个结构蛋白(VP1-VP4,VP6,VP7)和5个非结构蛋白(NSP1-NSP5),长度分别为3 287 bp,2 717 bp,2 591 bp,2 362 bp,1 356 bp,1 042 bp,1 532 bp,1 042 bp,1 017 bp,750 bp,663 bp。其中VP4、VP6、VP7是GPRV的主要抗原性基因[9-16]。每个基因片段分别包含一个开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)[6],长度分别为3 267 bp,2 673 bp,2 508 bp,2 362 bp,1 194 bp,981 bp,1 461 bp,954 bp,942 bp,528 bp和594 bp另外,GPRV CH-1株的VP1,VP3,VP4,VP6,VP7和NSP4基因主要与人或猪RV的基因的进化距离最近,其同源性见表1[10-15]。

表1 GPRV CH-1株基因序列与人和猪RV的同源性Tab.1 Homologies for the rotavirus genes from giant panda,human and porcine
2 病毒蛋白
蛋白质是病毒粒子的主要成分,具有重要的功能。……
