人KIAA0146基因及蛋白质的生物信息学分析
2018-09-28刘雪梅彭仲特
周 飞,刘雪梅,彭仲特
(韩山师范学院食品工程与生物科技学院,中国广东潮州521041)
DNA损伤的同源重组修复功能障碍往往会导致严重的基因组不稳定,从而促进肿瘤的发生和演进。同源重组修复是多种蛋白质分子协同参与、巧妙配合并精准完成的DNA损伤修复过程。同源重组修复过程中,RAD51重组酶和BLM解旋酶协同作用组装成关键的蛋白质复合体[1,2],确保DNA损伤修复高度准确。2013年首次发现SPIDR(新基因KIAA0146编码)作为支架蛋白质分别与BLM和RAD51相互作用,此发现解密了BLM/RAD51复合体组装的分子机制,同时也表明KIAA0146在同源重组修复中起关键作用[3]。该研究报道,下调KIAA0146基因表达导致BLM和RAD51不能有效定位细胞的DNA损伤位点,使姐妹染色单体交换水平明显增高;而且,降低KIAA0146基因表达也会导致细胞基因组不稳定,同时提高细胞对DNA损伤剂的敏感性[3]。除此之外,结肠癌和前体B细胞淋巴细胞白血病中KIAA0146基因结构的完整性被破坏[4]。以上证据表明KIAA0146基因具有重要的分子功能,参与肿瘤的发生发展。不过迄今为止,KIAA0146基因相关的实验研究非常有限,因此本文用生物信息学的方法快速地对KIAA0146基因及其蛋白质结构、亚细胞定位及潜在分子功能进行分析,以对其进行深入研究提供线索及导向。
1 材料与方法
KIAA0146基因(Gene ID:23514)及其蛋白质序列来自NCBI数据库。利用在线软件对KIAA0146基因及其蛋白质进行分析,并得出相应结果。本研究采用的在线软件见表1。
2 结果与分析
2.1 人KIAA0146基因启动子分析
NCBI数据库检索发现,人KIAA0146基因(Gene ID:23514)定位于8q11.21,全长475 124 bp,含29个外显子。……
