磁珠法快速提取基因组DNA的实验研究
2018-09-22郑春辉孙智勇
生物信息学 2018年3期
许 朋,郑春辉,孙智勇,余 兰,冯 昆*
(1.遵义医学院 药学院,贵州 遵义 563099;2. 中药基础与应用研究重点实验室, 遵义医学院 珠海校区,广东 珠海 519000)
随着分子生物学和医学技术的快速进步,分离技术正朝着简便快捷、高质量、高纯度、高通量方向发展,以满足大样本、高质量的实验要求。近年来磁性纳米材料在核酸分离领域越来越受瞩目,其具有比表面积大、稳定性好、多种表面官能团修饰等优点[1],此外,磁珠颗粒的固相提取方法大大简化了核酸的提取流程,基于此已经广泛应用[2-5]。目前市面上所销售基于磁性分离技术的核酸分离试剂盒等商品,绝大多数为国外产品,这类试剂盒价格昂贵,很难得到广泛应用。据此,本实验针对提取基因组DNA,通过对分离流程改进和试剂体系开发,对不同提取条件和步骤进行了量化比较和条件优化,同时比较了市售类似产品,建立了快速提取基因组DNA的方法和试剂体系;对影响DNA提取效率的各个因素以及DNA与磁珠的结合情况分析与探讨,建立了一种快速提取基因组DNA的磁性分离技术。
1 材料与方法
1.1 材料
小鼠肺组织[SPF级小鼠,品系:CD-1©(ICR) IGS Mice,购自北京维通利华实验动物技术有限公司,许可证号:SCXK(京)2011- 0011],二氧化硅包覆磁性纳米微球(河南惠尔生物科技有限公司)
1.2 试剂
蛋白酶K、溶菌酶、盐酸胍(Gu-HCl)及琼脂糖(均购于Sigma公司);核酸染料GlodView(北京索莱宝生物);DNA Marker DL2000及上样缓冲液(均购于大连宝生物);EDTA、SDS、Triton-100、氯化钠、柠檬酸钠、柠檬酸钾、氯化锂及MOPS(均为分析纯,购于麦克林公司);……
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