顾 浩，陈寅萤，王朋倩，王 忠

（中国中医科学院1.中医临床基础医学研究所，3.中药研究所，北京 100700；2.中国中医科学院广安门医院科研处，北京 100053）

冠心病是冠状动脉粥样硬化使血管腔狭窄或阻塞或（和）因冠状动脉功能性改变（痉挛）导致心肌缺血缺氧或坏死而引起的一类心脏病［1］。目前已知的冠心病致病基因达上百个，且关系网络复杂，利用单基因单靶点的一对一分析，很难发现核心致病基因群及其主要的生物学功能［2］。利用网络模块划分方法，可以更好地分析疾病网络的结构和功能，有助于发现疾病关键基因群［3］。

随着组学技术和大数据的发展，生命科学在人体和疾病的生物分子层面积累了大量的数据［4-5］，网络为大量生物信息的整合提供了有效手段［6-7］。基于生物网络的模块划分方法，成为网络简化分解和抽提新知识的重要途径［8-9］。从网络节点在模块中的分布重叠情况，模块划分方法可以分为重叠模块和非重叠模块划分方法。目前，常用的重叠模块划分方法主要包括MCLiQUE，Cluster one，NCMine，PEW⁃CC和Fuzzifier cluster等算法［10］。非重叠模块划分方 法 包 括 Community cluster（glay），Connected component cluster，MCL cluster，MCODE cluster，Spectral clusters of protein sequences和AP等［11］。

面对众多的模块划分方法，如何选择一个优化的模块划分方法对网络进行结构和功能解析，从而得到一个相对稳定可靠的结果，是目前模块研究的重要内容。有研究者提出了网络结构熵的概念，可以有效地刻画无尺度网络的无序性［12-15］。本研究团队前期利用网络结构熵计算方法，对中药成分干预脑缺血的药理网络进行了模块划分结果的熵值计算［15］。……