湖北地区猪瘟病毒流行株E2基因的序列测定与分析
2018-08-13田永祥周丹娜段正赢杨克礼刘泽文袁芳艳
郭 锐,田永祥,周丹娜,刘 威,段正赢,杨克礼,刘泽文,袁芳艳,高 婷
(1.湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,湖北 武汉 430064;2.农业部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室,湖北 武汉 430064;3.农业部兽用药物与诊断技术湖北科学观测实验站,湖北 武汉 430064;4.动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北 武汉 430064)
猪瘟(Classical swine fever,CSF)是由黄病毒科(Flaviviridae)瘟病毒属(Pestivirus)的猪瘟病毒(CSFV)所引起高热、出血和高死亡率为特征的接触性传染病[1],被世界动物卫生组织(OIE)列入须申报的动物传染病目录,我国将其列为一类动物疫病。我国1954年成功研制出猪瘟兔化弱毒疫苗(HCLV),推广应用至今,较好地控制了猪瘟的大规模暴发和流行,免疫保护率一直在90%以上,但该病近几年在全国各地呈零星散发性流行,临床表现日趋复杂,必须引起我们兽医工作者的足够重视。
CSFV基因序列全长约12.3 Kb,病毒基因序列两端各有一个非编码区(5'-UTR和3'-UTR),非编码区中间仅有一个大的开放阅读框(ORF),能够编码3 898个氨基酸,其可构成12种蛋白质,有4个结构蛋白(C、Erns、E1、E2)和 8 个非结构蛋白(Npro、P7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A、NS5B)。E2蛋白是CSFV最重要的结构性蛋白,也是最重要的功能性蛋白,是目前研究最为透彻的蛋白。在病毒感染宿主细胞的过程中,E2蛋白能与宿主细胞表面相应的特异性受体结合,介导病毒的侵入。虽然E2蛋白是CSFV最重要的保护性抗原,但它也是CSFV编码的所有蛋白保守性最差的一个,含有A、B、C 3个抗原结构域。这些区域中的一些与中和性密切相关的氨基酸序列或位点有着极高的突变频率,从而对E2蛋白整体的免疫原性产生影响,这可能也是造成疫苗株与野毒株免疫原性差异的根本原因。……
