大口黑鲈组织蛋白酶B基因SNP筛选及其与生长性状关联分析
2018-03-21李胜杰周春龙白俊杰吴建开樊佳佳费志平孙建国马冬梅
李胜杰,周春龙,白俊杰,,吴建开,樊佳佳,费志平,孙建国,马冬梅
(1.中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室, 广州 510380;2.南京帅丰饲料有限公司,南京 211306;3.湖州湖旺水产种业有限公司,浙江湖州 313000;4.淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心,武汉 430070)
组织蛋白酶(Cathepsin)属于木瓜蛋白酶超家族半胱氨酸蛋白酶,具有蛋白质的加工、修饰和调控应答等生物学功能。Cathepsin B(CTSB)是最早被关注的组织蛋白酶[1],该酶可降解肌球蛋白,且对肌动蛋白的降解能力要小于肌球蛋白。花腹鲭(Scomberaustralasicus)CTSB对肌原纤维蛋白产生明显降解作用[2]。CTSB基因参与细胞凋亡的发生[2-3]。CTSB基因在猪(Susscrofa)前体脂肪细胞分化过程中发挥调控作用,提高CTSB的表达,能促进猪前体脂肪细胞分化[4]。CTSB基因的突变对肉质和生长性状产生影响作用,如猪CTSB基因多态性与背膘厚显著和日增重存在相关[5],牛(BosTaurus)CTSB基因内含子中的SNP位点与其体重和牛肉大理石纹性状密切相关[6]。目前对于鱼类CTSB的功能研究方面,鲢[7-8](Hypophthalmichthysmolitrix)、蓝圆鲹(Decapterusmaruadsi)[9]和松江鲈[10](Trachidermusfasciatus)等鱼类的CTSB基因序列已被克隆分离得到,且其活性得到证实,但关于鱼类CTSB基因多态性与生长性状的相关性研究还未见报道。
大口黑鲈(Micropterussalmoides)原产于美国和加拿大,1983年被引进到我国大陆进行养殖,现已成为国内的名优淡水经济养殖品种之一[11-12]。鉴于CTSB基因是影响生长性状的重要候选基因[13],本研究从大口黑鲈CTSB基因中筛选SNP位点,并分析SNP位点与生长性状的相关性,为大口黑鲈分子标记辅助育种提供基础。……
