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基于DNA条形码技术的永暑礁泻湖鱼卵鉴定研究

2018-03-21郭华阳朱克诚杨静文江世贵张殿昌

淡水渔业 2018年2期
关键词:数据库研究

吴 娜,张 楠,曹 明,郭华阳,朱克诚,杨静文,江世贵,张殿昌

(1.中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东省渔业生态环境重点开放实验室,广州 510300;2.上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306;3.广东省渔业种质保护中心,广州 510300)

鱼卵和仔稚鱼是鱼类生活史的早期阶段,鱼卵和仔稚鱼调查是研究鱼类繁殖习性、生殖洄游路线、产卵场、种类分布和种群动态的基础,也可为鱼类人工繁育技术和生理生化机制研究提供基础数据[1]。鱼卵和仔稚鱼种类的准确鉴别,是开展鱼卵和仔稚鱼研究的重要前提。通常,鱼卵鉴别主要依据卵的形状、大小、卵周隙、油球、内膜、绒毛膜、卵黄形态和胚胎形状等形态特征[2],然而近缘物种的鱼卵由于形态相似很难区分,大多种类只能鉴定到科或属的水平,目前只有极少种类鱼卵鉴定到种的水平,寻求稳定、准确的分类依据和鉴定方法,是鱼类浮游生物研究亟待解决的关键问题。DNA条形码(DNA barcoding)技术是一种利用标准基因区域序列多态性进行物种鉴定的分子方法,条形码序列分析不依赖于形态特征,对形态特征近似,形态学分类比较困难的疑难种类的分类以及形态学分类上存有疑问种类的验证提供了新的方法和手段[3-4]。鱼类线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(mtCOI)基因具有序列变异水平适中,变异区域两端序列高度保守和序列长度适宜的特点,是被广泛接受的鱼类DNA条形码标准基因[5-7],目前鱼类DNA条形码数据库(Barcode of Life Data System [BOLD])中已有超过17.5万件凭证标本,代表了1.5万种以上的鱼类种类[8]。……

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