鼠尾草叶绿体基因组序列分析
2017-11-11何懿菡韩立敏刘玉萍王喆之
何懿菡 韩立敏 刘玉萍 田 娜 苏 旭 王喆之*
(1.陕西师范大学生命科学学院,药用资源与天然药物化学教育部重点实验室,西北濒危药材资源开发国家工程实验室,西安 710119; 2.青海师范大学生命与地理科学学院,西宁 810008; 3.陕西学前师范学院生命科学与食品工程学院,西安 710061)
鼠尾草叶绿体基因组序列分析
何懿菡1,2韩立敏3刘玉萍2田 娜1苏 旭2王喆之1*
(1.陕西师范大学生命科学学院,药用资源与天然药物化学教育部重点实验室,西北濒危药材资源开发国家工程实验室,西安 710119;2.青海师范大学生命与地理科学学院,西宁 810008;3.陕西学前师范学院生命科学与食品工程学院,西安 710061)
鼠尾草(Salviajaponica)是唇形科(Labiatae)鼠尾草属(Salvia)的一种多年生草本植物,具有十分重要的药用和经济价值。本文采用第二代测序技术Illumina Hiseq平台对鼠尾草的叶绿体基因组进行测序,同时以鼠尾草近缘物种丹参叶绿体基因组作为参考,组装得到完整叶绿体基因组序列。结果表明,鼠尾草叶绿体基因组序列全长153 995 bp,呈典型的四段式结构,其中LSC区长84 573 bp,SSC区长19 874 bp,两个IR区分别长24 774 bp;鼠尾草叶绿体基因组成功注释13组叶绿体基因,基因的种类、数目及GC含量等与唇形科中其它物种较为类似。这些研究结果丰富了鼠尾草属的叶绿体基因组数据,为今后鼠尾草属植物系统发育关系重建积累了基础性数据。
鼠尾草属;鼠尾草;叶绿体基因组;基因结构;系统进化
鼠尾草(Salviajaponica)是唇形科(Labiatae)、鼠尾草属(Salvia)中的一种多年生草本植物,在我国主要分布于横断山区,占鼠尾草属物种总数的52.8%,尤其是特有种数目较多,高达23种[1]。……
